More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0333 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  100 
 
 
451 aa  889    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  41.63 
 
 
472 aa  343  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  42.86 
 
 
467 aa  341  1e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  38.24 
 
 
455 aa  272  7e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  33.77 
 
 
467 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  36.22 
 
 
449 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  33.48 
 
 
477 aa  232  8.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  35.07 
 
 
447 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  35.54 
 
 
447 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  35.39 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  32.35 
 
 
455 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  32.43 
 
 
455 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  31.73 
 
 
455 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  34.84 
 
 
449 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  31.92 
 
 
455 aa  209  8e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  33.1 
 
 
456 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  35.32 
 
 
447 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  30.3 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  31.93 
 
 
454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  32.02 
 
 
454 aa  195  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  32.65 
 
 
451 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  31.47 
 
 
455 aa  193  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  33.72 
 
 
455 aa  189  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  31.7 
 
 
456 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  32.96 
 
 
461 aa  187  4e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  30.19 
 
 
466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  30.23 
 
 
442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  31.33 
 
 
452 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.37 
 
 
448 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  28.48 
 
 
448 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  28.29 
 
 
460 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  29.07 
 
 
460 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  28.6 
 
 
446 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  28.45 
 
 
462 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  26.28 
 
 
452 aa  162  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  28.89 
 
 
464 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  29.52 
 
 
456 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  26.21 
 
 
439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  27.68 
 
 
450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  29.36 
 
 
461 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  28.51 
 
 
460 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  28.2 
 
 
460 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  27.41 
 
 
460 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  28.95 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  28.86 
 
 
466 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  27.73 
 
 
496 aa  151  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  28 
 
 
448 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  29.38 
 
 
466 aa  151  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
458 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  28.67 
 
 
459 aa  150  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  27.53 
 
 
448 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  29.34 
 
 
454 aa  149  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  28.41 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  28.41 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  28.8 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  30.18 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  27.56 
 
 
485 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  26.49 
 
 
452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  26.71 
 
 
447 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  29.17 
 
 
466 aa  146  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  27.8 
 
 
448 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  29.3 
 
 
451 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  28.31 
 
 
470 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  28.35 
 
 
496 aa  143  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  27.06 
 
 
451 aa  143  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  27.77 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  27.38 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  27.38 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  29.26 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.62 
 
 
451 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  26.52 
 
 
449 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  30.05 
 
 
467 aa  140  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  26.1 
 
 
493 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  27.38 
 
 
451 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  26.43 
 
 
464 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  27.54 
 
 
478 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  26.96 
 
 
449 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
460 aa  137  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  25.34 
 
 
448 aa  137  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
440 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  28.82 
 
 
437 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  25.22 
 
 
465 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  28.82 
 
 
437 aa  132  9e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  26.62 
 
 
455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  28.81 
 
 
459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  29.93 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  24.28 
 
 
443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  26.52 
 
 
442 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  26.93 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  27.87 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.65 
 
 
472 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  28.1 
 
 
473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  27.09 
 
 
451 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.02 
 
 
448 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  26.27 
 
 
453 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.16 
 
 
462 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  26.65 
 
 
445 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  25.5 
 
 
464 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>