More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0319 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  676    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  51.68 
 
 
330 aa  344  2e-93  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.52 
 
 
329 aa  332  6e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  52.27 
 
 
332 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.46 
 
 
331 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  51.68 
 
 
337 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.4 
 
 
332 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.47 
 
 
332 aa  318  6e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  52.34 
 
 
332 aa  317  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  51.23 
 
 
331 aa  315  6e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  50.88 
 
 
327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.07 
 
 
350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  50.16 
 
 
337 aa  311  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  48 
 
 
324 aa  311  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.15 
 
 
332 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  47.38 
 
 
330 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.69 
 
 
333 aa  309  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.54 
 
 
342 aa  309  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.69 
 
 
332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  49.84 
 
 
325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  48.35 
 
 
333 aa  306  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  48.32 
 
 
318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.19 
 
 
329 aa  306  3e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  47.24 
 
 
315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  45.9 
 
 
320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  49.21 
 
 
340 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.79 
 
 
432 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  51.57 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  48.17 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.09 
 
 
317 aa  302  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.63 
 
 
327 aa  301  7.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  50 
 
 
334 aa  301  8.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.89 
 
 
378 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  48.92 
 
 
328 aa  301  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.21 
 
 
350 aa  299  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.78 
 
 
353 aa  298  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  48.15 
 
 
318 aa  298  9e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.43 
 
 
344 aa  297  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  48.01 
 
 
321 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.71 
 
 
333 aa  298  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  46.93 
 
 
333 aa  298  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.21 
 
 
354 aa  297  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  49.4 
 
 
369 aa  297  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  49.69 
 
 
339 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  46.36 
 
 
328 aa  296  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  47.53 
 
 
318 aa  296  4e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.38 
 
 
362 aa  296  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  48.73 
 
 
344 aa  295  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  47.75 
 
 
371 aa  295  8e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.48 
 
 
346 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.51 
 
 
329 aa  294  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  46.11 
 
 
316 aa  294  1e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  48.18 
 
 
345 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  47.38 
 
 
347 aa  293  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  45.62 
 
 
326 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  49.68 
 
 
318 aa  292  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  45.45 
 
 
326 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  45.85 
 
 
318 aa  292  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.79 
 
 
396 aa  291  7e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  49.52 
 
 
318 aa  291  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  45.77 
 
 
332 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  48.42 
 
 
331 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  47.15 
 
 
370 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  45.35 
 
 
319 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  48.42 
 
 
331 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  45.43 
 
 
320 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  49.84 
 
 
348 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  46.91 
 
 
323 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.86 
 
 
329 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  47.56 
 
 
322 aa  289  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  47.62 
 
 
335 aa  288  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  46.27 
 
 
339 aa  288  9e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  49.07 
 
 
369 aa  287  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  45.96 
 
 
318 aa  287  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  49.68 
 
 
318 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  49.68 
 
 
318 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  49.68 
 
 
318 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  49.52 
 
 
318 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  48.57 
 
 
318 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  49.21 
 
 
316 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  49.05 
 
 
318 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  47.94 
 
 
318 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  47.65 
 
 
333 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  47.94 
 
 
318 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  47.94 
 
 
318 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.94 
 
 
318 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  47.65 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.16 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  48.42 
 
 
345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  51.43 
 
 
400 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  47.65 
 
 
333 aa  286  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  44.68 
 
 
325 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  45.24 
 
 
319 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.81 
 
 
356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  48 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.29 
 
 
335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.79 
 
 
328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1989  Von Willebrand factor type A domain containing membrane protein  44.68 
 
 
359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  43.43 
 
 
347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>