More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0299 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  100 
 
 
139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  45.74 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  47.66 
 
 
129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
143 aa  107  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  37.1 
 
 
136 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.62 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  34.75 
 
 
138 aa  90.1  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  34.75 
 
 
138 aa  90.1  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
134 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.85 
 
 
131 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.85 
 
 
131 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
131 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.85 
 
 
131 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  37.04 
 
 
144 aa  86.7  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
154 aa  86.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.62 
 
 
132 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 
146 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  34.62 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.62 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  34.62 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  34.62 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.62 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  36.57 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
169 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  34.59 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  34.06 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.22 
 
 
130 aa  84.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  34.04 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.62 
 
 
129 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.85 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.34 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
144 aa  84  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
133 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
153 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.38 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
129 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
133 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  32.58 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  37.78 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  38.46 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  39.42 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  35.11 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  39.42 
 
 
138 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  39.42 
 
 
138 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  33.59 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.08 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  34.65 
 
 
322 aa  81.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  34.75 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  40.38 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  41.27 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  39.22 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  39.22 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  34.68 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  44.9 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  38.1 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  37.5 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.85 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  32.31 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  35.94 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  34.06 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  30.66 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  32.37 
 
 
347 aa  77.4  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
147 aa  77  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  34.48 
 
 
136 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
133 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.67 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  36.22 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  36.22 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  35.43 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.67 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  34.62 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  33.85 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  33.83 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>