189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0275 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 
221 aa  441  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  41.11 
 
 
176 aa  71.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  29.69 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  33.58 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  32.35 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  40 
 
 
267 aa  68.6  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  32.35 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  32.12 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  31.39 
 
 
337 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  32.35 
 
 
337 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  31.39 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  31.39 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  33.33 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  31.39 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  38.96 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  36.05 
 
 
448 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  36.05 
 
 
448 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  41.33 
 
 
453 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  31.39 
 
 
337 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  28.98 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  37.18 
 
 
453 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  31.78 
 
 
453 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  34.57 
 
 
420 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  38.55 
 
 
297 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  37.93 
 
 
346 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  27.06 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  27.06 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  27.06 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  30.81 
 
 
287 aa  60.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  34.12 
 
 
420 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  29.22 
 
 
228 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  34.58 
 
 
269 aa  58.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  26.2 
 
 
227 aa  58.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  26.47 
 
 
228 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  28.17 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  32.56 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  30.43 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  35.23 
 
 
338 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  37.18 
 
 
528 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  29.73 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  34.62 
 
 
527 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  34.57 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  34.62 
 
 
527 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  34.95 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  31.25 
 
 
234 aa  56.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0516  membrane associated protease-like  36.62 
 
 
453 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  34.19 
 
 
246 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  39.73 
 
 
280 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  30.1 
 
 
235 aa  55.1  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44438  predicted protein  32.95 
 
 
458 aa  55.1  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.426284  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  30.25 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  24 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  33.02 
 
 
273 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  38.67 
 
 
452 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0124  abortive infection protein  38.55 
 
 
180 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  32.04 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  34.44 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2082  Abortive infection protein  43.28 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17021  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  29.66 
 
 
268 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  38.27 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 
288 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  29.66 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  29.66 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  34.62 
 
 
480 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1085  CAAX amino terminal protease family protein  33.77 
 
 
130 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0529002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  33.01 
 
 
250 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  26.95 
 
 
227 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  26.71 
 
 
241 aa  52.4  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  32.56 
 
 
362 aa  52.4  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  34.21 
 
 
538 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  30.33 
 
 
302 aa  52  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0797  abortive infection protein  38.54 
 
 
521 aa  52  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.115153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  27.88 
 
 
234 aa  52  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  24.47 
 
 
237 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2041  protease, putative  34.44 
 
 
287 aa  52  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00120483  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2182  abortive infection protein  39.06 
 
 
511 aa  51.6  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0783395  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  31.07 
 
 
249 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  31.71 
 
 
278 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  39.74 
 
 
285 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  27.83 
 
 
237 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  27.83 
 
 
237 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  31.52 
 
 
261 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  34.69 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  30.1 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  27.35 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  37.5 
 
 
527 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  33.04 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  41.33 
 
 
333 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2845  Abortive infection protein  37.5 
 
 
290 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.957668  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  29.31 
 
 
308 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0659  abortive infection protein  38.46 
 
 
328 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  33.94 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  31.07 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  36.08 
 
 
319 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  32.04 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  32.04 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  32.04 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>