More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0274 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 
597 aa  1228    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  49.83 
 
 
580 aa  600  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  49.82 
 
 
609 aa  586  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  44.79 
 
 
619 aa  544  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  47.33 
 
 
599 aa  538  9.999999999999999e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.7 
 
 
581 aa  527  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.27 
 
 
589 aa  520  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  43.66 
 
 
608 aa  521  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.96 
 
 
583 aa  516  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.77 
 
 
596 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  43.64 
 
 
593 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.64 
 
 
580 aa  495  1e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  41.35 
 
 
587 aa  488  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  43.75 
 
 
595 aa  486  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  41.35 
 
 
587 aa  488  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  37.74 
 
 
573 aa  433  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  38.26 
 
 
573 aa  435  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.78 
 
 
576 aa  431  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.82 
 
 
583 aa  420  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.53 
 
 
1091 aa  409  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  37.96 
 
 
597 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  37.12 
 
 
592 aa  391  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 
618 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  36.96 
 
 
604 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  35.46 
 
 
602 aa  379  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  36.48 
 
 
611 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  34.56 
 
 
590 aa  368  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  39.71 
 
 
598 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  36.85 
 
 
584 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  37.07 
 
 
593 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  33.97 
 
 
590 aa  346  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  36.68 
 
 
600 aa  346  8e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.97 
 
 
590 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  35.45 
 
 
606 aa  344  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.56 
 
 
593 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
599 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  35.12 
 
 
579 aa  327  4.0000000000000003e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.98 
 
 
573 aa  325  1e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  37.04 
 
 
581 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  35.62 
 
 
592 aa  323  8e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.15 
 
 
595 aa  322  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  34.02 
 
 
611 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  35.34 
 
 
624 aa  321  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  37.45 
 
 
581 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  33.86 
 
 
576 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.12 
 
 
577 aa  319  7.999999999999999e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  35.41 
 
 
609 aa  317  3e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.89 
 
 
627 aa  316  6e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  34.44 
 
 
1194 aa  316  8e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  32.36 
 
 
588 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.22 
 
 
572 aa  313  3.9999999999999997e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.63 
 
 
593 aa  313  7.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  34.12 
 
 
1228 aa  312  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  33.05 
 
 
598 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.71 
 
 
579 aa  311  2.9999999999999997e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
579 aa  310  5e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  34.22 
 
 
603 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.53 
 
 
577 aa  309  8e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  33.59 
 
 
600 aa  309  9e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.28 
 
 
588 aa  309  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.31 
 
 
581 aa  309  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  34.9 
 
 
578 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.99 
 
 
581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  32.95 
 
 
677 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.02 
 
 
618 aa  306  8.000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  33.33 
 
 
611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  34.44 
 
 
587 aa  305  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  36.88 
 
 
593 aa  304  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  31.37 
 
 
577 aa  303  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  31.37 
 
 
577 aa  303  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  33.39 
 
 
608 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  35.83 
 
 
579 aa  300  5e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  33.53 
 
 
588 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0881  ABC transporter component  33.45 
 
 
589 aa  297  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  36.76 
 
 
596 aa  297  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  32.45 
 
 
583 aa  296  9e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  32.54 
 
 
597 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  30.97 
 
 
578 aa  295  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  33.96 
 
 
596 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  30.97 
 
 
578 aa  295  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.05 
 
 
582 aa  293  5e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.8 
 
 
574 aa  293  8e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  30.63 
 
 
577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  33.39 
 
 
596 aa  290  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  33.69 
 
 
1138 aa  290  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  33.27 
 
 
603 aa  289  8e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  33.87 
 
 
581 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  32.42 
 
 
581 aa  287  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  36.59 
 
 
578 aa  287  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  33.51 
 
 
606 aa  286  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  33.72 
 
 
574 aa  286  9e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.68 
 
 
575 aa  282  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  33.72 
 
 
644 aa  281  3e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  33.52 
 
 
581 aa  279  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  34.72 
 
 
605 aa  279  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.51 
 
 
571 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  35.11 
 
 
581 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  35.22 
 
 
606 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.48 
 
 
571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  33.76 
 
 
579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>