109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0248 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0248  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  254  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000242831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1662  hypothetical protein  43.75 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0239  protein of unknown function DUF488  40.68 
 
 		 120 aa  100  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1851  protein of unknown function DUF488  44.25 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0782  protein of unknown function DUF488  43.1 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01761  hypothetical protein  43.36 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2016  hypothetical protein  43.36 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000520026  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2045  hypothetical protein  43.36 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01749  hypothetical protein  43.36 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.464208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1878  hypothetical protein  43.36 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1841  hypothetical protein  43.36 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527952  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1399  hypothetical protein  43.36 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2516  hypothetical protein  42.48 
 
 		 115 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.826147 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4793  protein of unknown function DUF488  41.07 
 
 		 115 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0905934 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1072  protein of unknown function DUF488  39.47 
 
 		 119 aa  93.6  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1448  hypothetical protein  39.83 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.790697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0330  hypothetical protein  41.44 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0032  protein of unknown function DUF488  40.87 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333631  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1902  protein of unknown function DUF488  39.34 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.963702  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4425  hypothetical protein  39.66 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222644  normal  0.987297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1901  hypothetical protein  42.48 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.45586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2081  hypothetical protein  42.48 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000626921 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1385  hypothetical protein  42.48 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1402  hypothetical protein  42.48 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.219828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1369  hypothetical protein  42.48 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.623897 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0478  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  90.1  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0416  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  90.1  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318047  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0525  hypothetical protein  40.18 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2090  hypothetical protein  40.65 
 
 		 120 aa  90.1  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0440  protein of unknown function DUF488  36.36 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1898  hypothetical protein  40.54 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.715816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0088  hypothetical protein  39.82 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0412988 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1802  hypothetical protein  40.71 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2628  hypothetical protein  39.09 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1211  hypothetical protein  37.93 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3473  hypothetical protein  39.47 
 
 		 118 aa  87  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8395  protein of unknown function DUF488  43.4 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313656  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22160  hypothetical protein  36.75 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2498  hypothetical protein  38.53 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2562  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0361226  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0651  hypothetical protein  39.83 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.249398 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0089  protein of unknown function DUF488  40 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0871  hypothetical protein  37.72 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.192956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3442  hypothetical protein  40.91 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3152  hypothetical protein  36.52 
 
 		 123 aa  84.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1714  hypothetical protein  40.91 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.735817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0222  hypothetical protein  40.91 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0228  hypothetical protein  40.91 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3358  protein of unknown function DUF488  40.83 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4130  hypothetical protein  36.36 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1965  protein of unknown function DUF488  41.07 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4278  protein of unknown function DUF488  36.61 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0520  hypothetical protein  38.18 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2259  protein of unknown function DUF488  39.82 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2811  hypothetical protein  37.38 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3675  hypothetical protein  38.26 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020732  hitchhiker  0.000000942078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0695  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0106  protein of unknown function DUF488  33.63 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21720  hypothetical protein  34.21 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.803231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1762  hypothetical protein  36.52 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3257  hypothetical protein  36.36 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.544396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1515  protein of unknown function DUF488  34.51 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.933464  normal  0.210794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3373  hypothetical protein  38.18 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4102  hypothetical protein  36.52 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.576882  normal  0.0548899 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2286  protein of unknown function DUF488  35.14 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0798  protein of unknown function DUF488  35.9 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000164638  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4646  hypothetical protein  35.45 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3092  hypothetical protein  38.18 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2617  protein of unknown function DUF488  41.07 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3631  hypothetical protein  33.64 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5031  hypothetical protein  46.58 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1094  protein of unknown function DUF488  40.35 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3653  protein of unknown function DUF488  34.55 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000515304  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4868  hypothetical protein  33.93 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0289  hypothetical protein  36.04 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0136906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0778  protein of unknown function DUF488  33.33 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000129789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0156  hypothetical protein  37.84 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4493  hypothetical protein  36.04 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0599  hypothetical protein  32.23 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000224589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4313  hypothetical protein  34.78 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1755  protein of unknown function DUF488  33.62 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0661  hypothetical protein  33.93 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.667112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50620  hypothetical protein  32.52 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0346513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0450  hypothetical protein  31.03 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0551  protein of unknown function DUF488  32.73 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3588  protein of unknown function DUF488  38.18 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3731  hypothetical protein  33.91 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.704488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2397  protein of unknown function DUF488  34.62 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000131309  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5164  hypothetical protein  30.97 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213776  normal  0.413293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3243  hypothetical protein  34.82 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6029  protein of unknown function DUF488  34.43 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0334  hypothetical protein  35.65 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0507685  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3431  hypothetical protein  34.86 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00932776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2555  hypothetical protein  31.13 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1197  protein of unknown function DUF488  30.51 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.800748  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1407  protein of unknown function DUF488  32.23 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.193708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0982  protein of unknown function DUF488  30.09 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0138018 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0858  hypothetical protein  29.57 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13090  hypothetical protein  33.62 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00020399  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>