284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0209 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  100 
 
 		 428 aa  845    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  54.16 
 
 		 422 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  30.75 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  28.73 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  31.05 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  28.73 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  30.54 
 
 		 440 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  31.07 
 
 		 577 aa  156  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  31.31 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  30.75 
 
 		 421 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  31.67 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  29.93 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  30.82 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  30.07 
 
 		 451 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  30.37 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  29.45 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  30.37 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  29.52 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  30.37 
 
 		 441 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  28.29 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  30.07 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  27.89 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  28.25 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  31.45 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  29.38 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  29.38 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  29.38 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  29.38 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  28.57 
 
 		 428 aa  146  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  29.98 
 
 		 426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  28.74 
 
 		 422 aa  146  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  28.31 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  31.53 
 
 		 444 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  31 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  31.53 
 
 		 444 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  29.25 
 
 		 427 aa  142  8e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  28.18 
 
 		 431 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  30.79 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  31 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  31.24 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  30.79 
 
 		 444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  30.79 
 
 		 444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  30.56 
 
 		 444 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  27.4 
 
 		 440 aa  141  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  29.37 
 
 		 423 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  30.32 
 
 		 441 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  29.5 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  29.61 
 
 		 431 aa  137  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  28.17 
 
 		 424 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  27.57 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  28.36 
 
 		 408 aa  133  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  28.97 
 
 		 424 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  29.76 
 
 		 422 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  29.09 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  27.58 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  25.45 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  27.51 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  24.83 
 
 		 967 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  27.64 
 
 		 447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  27.59 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  26.14 
 
 		 444 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  26.14 
 
 		 444 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  25.38 
 
 		 447 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  26.13 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  26.82 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  29.46 
 
 		 447 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  25.36 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  26.06 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  23.69 
 
 		 465 aa  99.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  24.65 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  24.83 
 
 		 411 aa  94.4  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  32.57 
 
 		 427 aa  93.2  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  31.58 
 
 		 427 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  24.28 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  23.76 
 
 		 421 aa  88.2  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  25.39 
 
 		 421 aa  87  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  22.2 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  22.55 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  25.45 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  25.78 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  24.54 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  25.17 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  22.08 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  25.24 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  22.09 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  25.56 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  22.22 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  22.34 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  20.3 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  22.1 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  20.51 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  23.48 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  22.85 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  23.1 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  24.81 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  22.85 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  22.85 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  23.15 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  22.06 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  24.01 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>