More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0205 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  100 
 
 
354 aa  729    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  38.31 
 
 
357 aa  202  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  42.07 
 
 
633 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  32.68 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 
612 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  34.83 
 
 
468 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  36.71 
 
 
472 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  31.67 
 
 
481 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  36.5 
 
 
306 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  36.5 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  34.71 
 
 
680 aa  87  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 
1392 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  32.04 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  26.11 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  34.25 
 
 
275 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  34.25 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  26.26 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  28.68 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.43 
 
 
805 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  32.35 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.93 
 
 
596 aa  69.7  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  28.12 
 
 
584 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  25.42 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  28.65 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  28.34 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  27.32 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.25 
 
 
611 aa  67  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  32.05 
 
 
2132 aa  66.6  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  31.29 
 
 
513 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  32.14 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  24.61 
 
 
536 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  26.88 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  22.95 
 
 
1139 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 
308 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  27.23 
 
 
584 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  25.49 
 
 
1027 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  31.97 
 
 
591 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  25.49 
 
 
1027 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  31.37 
 
 
364 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  25.49 
 
 
1027 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 
859 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.43 
 
 
648 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0850  adenylate/guanylate cyclase  26.35 
 
 
278 aa  63.2  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000130568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.29 
 
 
631 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  27.81 
 
 
304 aa  63.2  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  27.23 
 
 
465 aa  63.2  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 
1172 aa  62.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.66 
 
 
1149 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.97 
 
 
629 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  27.01 
 
 
279 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  31.3 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.33 
 
 
622 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  25.97 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  28.27 
 
 
462 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  26.44 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.51 
 
 
595 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  26.44 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.59 
 
 
643 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  29.14 
 
 
518 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  27.03 
 
 
735 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  30.71 
 
 
295 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  27.13 
 
 
529 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 
597 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.51 
 
 
598 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.58 
 
 
622 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  28.99 
 
 
603 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  27.22 
 
 
460 aa  60.1  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  28.81 
 
 
284 aa  60.1  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  26.81 
 
 
299 aa  60.1  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.83 
 
 
289 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  27.23 
 
 
446 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.12 
 
 
577 aa  60.1  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  32.17 
 
 
520 aa  59.7  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  26.71 
 
 
1358 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  28.98 
 
 
1805 aa  59.7  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  29.89 
 
 
523 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  25.56 
 
 
411 aa  59.3  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11664  hypothetical protein  29.05 
 
 
316 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.77538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  32.59 
 
 
348 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  32.58 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.14 
 
 
1141 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.47 
 
 
672 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0776  hypothetical protein  22.55 
 
 
441 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  0.576775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6225  putative adenylate/guanylate cyclase  26.43 
 
 
532 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  33.1 
 
 
348 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.4 
 
 
1749 aa  58.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  26.7 
 
 
270 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
1156 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  31.87 
 
 
515 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  25.93 
 
 
517 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  26.23 
 
 
1198 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  25.49 
 
 
861 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.47 
 
 
656 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  26.98 
 
 
526 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  24.31 
 
 
1148 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  30.9 
 
 
528 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  30.9 
 
 
528 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  30.9 
 
 
528 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  25.43 
 
 
312 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>