More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0181 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0178  methyl-accepting chemotaxis protein  71.84 
 
 		 696 aa  977    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000210736  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0181  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 696 aa  1398    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00160845  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0484  methyl-accepting chemotaxis protein  62.73 
 
 		 706 aa  823    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00175726  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0619  methyl-accepting chemotaxis protein  70.63 
 
 		 696 aa  939    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00139031  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0850  methyl-accepting chemotaxis protein  59.91 
 
 		 721 aa  797    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000224033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1009  methyl-accepting chemotaxis protein  64.42 
 
 		 697 aa  872    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1284  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  50.93 
 
 		 707 aa  657    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2142  methyl-accepting chemotaxis protein  54.72 
 
 		 712 aa  671    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2270  methyl-accepting chemotaxis protein  59.34 
 
 		 699 aa  803    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000173504  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2549  methyl-accepting chemotaxis protein  70.4 
 
 		 699 aa  962    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0016673  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2783  methyl-accepting chemotaxis protein  59.54 
 
 		 705 aa  787    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.260069  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0345  methyl-accepting chemotaxis protein DmcB  74.49 
 
 		 410 aa  568  1e-161  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0640  methyl-accepting chemotaxis protein  47.27 
 
 		 744 aa  474  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0072  methyl-accepting chemotaxis protein  51.74 
 
 		 712 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0347  methyl-accepting chemotaxis protein DmcA  40.1 
 
 		 729 aa  364  4e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1054  methyl-accepting chemotaxis protein  38.32 
 
 		 692 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00043245  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1386  methyl-accepting chemotaxis protein  39.01 
 
 		 611 aa  251  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.08 
 
 		 650 aa  244  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0346  protease PrtB  47.64 
 
 		 274 aa  223  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.88 
 
 		 663 aa  207  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.113755  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2162  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.68 
 
 		 665 aa  205  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.22 
 
 		 695 aa  204  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2151  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.28 
 
 		 656 aa  195  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1435  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.43 
 
 		 678 aa  194  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000167242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.72 
 
 		 664 aa  193  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0344435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1338  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 		 957 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.578016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.64 
 
 		 655 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3450  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.97 
 
 		 664 aa  181  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.43 
 
 		 658 aa  181  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  26.88 
 
 		 658 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.54 
 
 		 679 aa  177  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  26.52 
 
 		 658 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.76 
 
 		 609 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  26.6 
 
 		 658 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.22 
 
 		 657 aa  172  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  26.24 
 
 		 658 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  25.84 
 
 		 658 aa  170  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  25.84 
 
 		 658 aa  170  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  26.47 
 
 		 658 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.17 
 
 		 608 aa  168  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  27.55 
 
 		 660 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  27.55 
 
 		 660 aa  165  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  27.55 
 
 		 660 aa  165  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  27.55 
 
 		 660 aa  165  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  27.55 
 
 		 660 aa  165  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.53 
 
 		 640 aa  164  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  27.81 
 
 		 660 aa  164  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  26.62 
 
 		 660 aa  163  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  26.47 
 
 		 658 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.07 
 
 		 660 aa  163  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  26.71 
 
 		 650 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  26.71 
 
 		 650 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3209  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  27.43 
 
 		 601 aa  160  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2894  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  27.43 
 
 		 605 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.955347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.68 
 
 		 951 aa  160  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143462  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0606  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  27.69 
 
 		 617 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535208  normal  0.212062 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.91 
 
 		 660 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3471  putative methyl-accepting chemotaxis protein  27.43 
 
 		 605 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  26.37 
 
 		 648 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  26.99 
 
 		 660 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  25.84 
 
 		 658 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  27.45 
 
 		 660 aa  159  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  27.46 
 
 		 660 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.15 
 
 		 630 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  27.36 
 
 		 660 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.5 
 
 		 660 aa  157  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.48 
 
 		 675 aa  157  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.33 
 
 		 661 aa  156  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  26.58 
 
 		 660 aa  156  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.32 
 
 		 654 aa  156  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706955  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.66 
 
 		 659 aa  156  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  28.57 
 
 		 627 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  26.71 
 
 		 650 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.65 
 
 		 648 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.75 
 
 		 599 aa  154  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 625 aa  154  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3894  methyl-accepting chemotaxis protein  27.32 
 
 		 601 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0518753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3975  methyl-accepting chemotaxis protein  27.16 
 
 		 601 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0112  putative methyl-accepting chemotaxis protein  27.16 
 
 		 605 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.37 
 
 		 660 aa  153  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  26.85 
 
 		 660 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  25.59 
 
 		 660 aa  152  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.24 
 
 		 596 aa  152  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.71 
 
 		 630 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.74 
 
 		 599 aa  151  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.79 
 
 		 657 aa  151  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3992  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.74 
 
 		 599 aa  151  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.69 
 
 		 720 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000403269  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.74 
 
 		 599 aa  151  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  25.12 
 
 		 629 aa  150  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  28.46 
 
 		 630 aa  150  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.23 
 
 		 660 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3477  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.01 
 
 		 606 aa  150  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1081  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.77 
 
 		 629 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5151  methyl-accepting chemotaxis protein  24.96 
 
 		 666 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.35 
 
 		 632 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5980  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.54 
 
 		 599 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5124  methyl-accepting chemotaxis protein  24.96 
 
 		 669 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4724  methyl-accepting chemotaxis protein  24.96 
 
 		 666 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  25.65 
 
 		 660 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>