More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0134 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  100 
 
 		 508 aa  1043    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  43.64 
 
 		 576 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 500 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40 
 
 		 503 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  36.68 
 
 		 496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 485 aa  309  6.999999999999999e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  37.09 
 
 		 489 aa  308  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 		 479 aa  304  3.0000000000000004e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  36.59 
 
 		 476 aa  301  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.59 
 
 		 476 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 		 494 aa  294  2e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 		 479 aa  286  7e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  36.63 
 
 		 473 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 478 aa  282  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 		 484 aa  277  4e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 		 479 aa  276  6e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 		 479 aa  274  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  37.31 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 		 480 aa  266  7e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 493 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 491 aa  249  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  30.26 
 
 		 511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 965 aa  243  7e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  30.06 
 
 		 475 aa  229  7e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.39 
 
 		 472 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 461 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 470 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 464 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  26.21 
 
 		 464 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 464 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  29.06 
 
 		 387 aa  137  5e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  29.49 
 
 		 698 aa  120  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 405 aa  113  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  25.86 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  25.18 
 
 		 409 aa  98.2  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 408 aa  96.7  8e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  25.26 
 
 		 416 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  26.53 
 
 		 404 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 409 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  24.91 
 
 		 416 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 375 aa  93.2  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  26.64 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  24.57 
 
 		 416 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  23.79 
 
 		 410 aa  89.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  23.79 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28.67 
 
 		 403 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50137  predicted protein  24.29 
 
 		 437 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563801  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  23.8 
 
 		 383 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 812 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  23.8 
 
 		 383 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  23.95 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  24.3 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  24.3 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  25.75 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  24.3 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  24.3 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3299  FAD dependent oxidoreductase  22.47 
 
 		 559 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  26.18 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  24.3 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 399 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  24.04 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  29.77 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  23.5 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  23.17 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  29.77 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  23.79 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  23.83 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  24.74 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  23.79 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  25.09 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 400 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  23.5 
 
 		 383 aa  80.1  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.13 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  23.77 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  24.82 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 496 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  25.25 
 
 		 400 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  24.07 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  23.46 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  22.93 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>