More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0110 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  100 
 
 		 343 aa  712    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  34.55 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  31.61 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  34.6 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  32.04 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  49.24 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.32 
 
 		 321 aa  133  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  29.58 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  33.99 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  47.01 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  47.01 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  29.55 
 
 		 301 aa  126  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  39.05 
 
 		 286 aa  125  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  29.62 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  27.22 
 
 		 367 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  39.44 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  29.37 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  30.55 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  29 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  29 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  48.03 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  37.1 
 
 		 282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  38.6 
 
 		 376 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  33.09 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  48.82 
 
 		 375 aa  119  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  38.56 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  46.61 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  40.36 
 
 		 238 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  39.22 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  31.06 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  49.57 
 
 		 524 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  42.45 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  30.51 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  30.06 
 
 		 309 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  44.53 
 
 		 431 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  44.09 
 
 		 441 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  41.22 
 
 		 392 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  45.8 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  43.31 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  32.44 
 
 		 314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  42.55 
 
 		 459 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  27.72 
 
 		 305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  48.25 
 
 		 687 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  48 
 
 		 697 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  42.31 
 
 		 402 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  42.31 
 
 		 445 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  48 
 
 		 697 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  46.83 
 
 		 425 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  46.27 
 
 		 229 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  41.79 
 
 		 453 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  41.73 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  29.05 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  43.51 
 
 		 456 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  47.2 
 
 		 699 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  47.2 
 
 		 400 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  42.31 
 
 		 454 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  48.33 
 
 		 421 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  48.33 
 
 		 421 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  37.84 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  42.75 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  45.19 
 
 		 569 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  37.17 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  46.4 
 
 		 674 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  46.22 
 
 		 676 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  31.1 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  46.4 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  45.38 
 
 		 681 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  45.74 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  43.28 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  45.74 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  47.11 
 
 		 615 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  42.19 
 
 		 274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  46.4 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  30 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  45.04 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  32.27 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  44.8 
 
 		 683 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  45.38 
 
 		 233 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  35.81 
 
 		 325 aa  110  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  43.55 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  31.22 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  46.03 
 
 		 425 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  46.28 
 
 		 621 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  41.27 
 
 		 527 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  44.44 
 
 		 482 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  31.98 
 
 		 334 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  41.54 
 
 		 332 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  41.73 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  30.77 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  45.74 
 
 		 446 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  44.53 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  28.27 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  29.45 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  46.9 
 
 		 690 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  34.64 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  41.18 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  44 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  42.4 
 
 		 651 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  44.35 
 
 		 472 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  37.58 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>