More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0101 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  100 
 
 		 714 aa  1483    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  46.39 
 
 		 729 aa  618  1e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  45.09 
 
 		 718 aa  606  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  45.53 
 
 		 705 aa  588  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  43.22 
 
 		 724 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  43.93 
 
 		 694 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  42.9 
 
 		 695 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  43.16 
 
 		 706 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  44.32 
 
 		 693 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  44.23 
 
 		 694 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  44.23 
 
 		 694 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  43.02 
 
 		 708 aa  558  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  41.83 
 
 		 697 aa  548  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  41.82 
 
 		 722 aa  545  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  42.28 
 
 		 693 aa  545  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  41.68 
 
 		 706 aa  540  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  40.95 
 
 		 696 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  41.24 
 
 		 707 aa  537  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  41.07 
 
 		 720 aa  537  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  42.4 
 
 		 693 aa  536  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  40.43 
 
 		 774 aa  533  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  41.59 
 
 		 721 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  39.56 
 
 		 712 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  43.6 
 
 		 722 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  44.04 
 
 		 718 aa  525  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  41.47 
 
 		 706 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  41.32 
 
 		 715 aa  525  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  39.64 
 
 		 711 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  42.32 
 
 		 719 aa  522  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  39.65 
 
 		 712 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  41.65 
 
 		 727 aa  521  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  44.46 
 
 		 700 aa  521  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  40.97 
 
 		 714 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  42.29 
 
 		 716 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  40.36 
 
 		 723 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  40.44 
 
 		 729 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  41.43 
 
 		 708 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  42.29 
 
 		 716 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  41.21 
 
 		 756 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  39.51 
 
 		 712 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  41.61 
 
 		 1464 aa  518  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  40.78 
 
 		 712 aa  513  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  40.85 
 
 		 758 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  40.72 
 
 		 755 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  39.89 
 
 		 711 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  42.03 
 
 		 701 aa  515  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  40.58 
 
 		 779 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  42.25 
 
 		 701 aa  515  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  42.77 
 
 		 710 aa  514  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  41.94 
 
 		 726 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  41.68 
 
 		 720 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  40.17 
 
 		 757 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  39.69 
 
 		 709 aa  511  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  40.72 
 
 		 758 aa  511  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  41.38 
 
 		 671 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  39.97 
 
 		 755 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  40.86 
 
 		 709 aa  506  9.999999999999999e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  41.41 
 
 		 704 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  41.47 
 
 		 721 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  40.86 
 
 		 715 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  40.11 
 
 		 721 aa  508  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  42.01 
 
 		 707 aa  508  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  40.25 
 
 		 708 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  40.26 
 
 		 720 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  41.97 
 
 		 712 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  40.56 
 
 		 686 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  39.55 
 
 		 1537 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  41.58 
 
 		 711 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  40.65 
 
 		 720 aa  502  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  39.04 
 
 		 710 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  41.58 
 
 		 711 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  41.63 
 
 		 721 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  41.53 
 
 		 706 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  40.93 
 
 		 718 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  39.72 
 
 		 720 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  40.08 
 
 		 733 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  41.17 
 
 		 788 aa  499  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  39.72 
 
 		 722 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  41.27 
 
 		 701 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  39.72 
 
 		 720 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  42.07 
 
 		 701 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  40.92 
 
 		 845 aa  496  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  39.61 
 
 		 704 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  41.41 
 
 		 738 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  40.66 
 
 		 728 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  39.42 
 
 		 765 aa  498  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  41.53 
 
 		 717 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  42.05 
 
 		 706 aa  495  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  40.69 
 
 		 752 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  40.11 
 
 		 723 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  40.12 
 
 		 717 aa  493  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  41.56 
 
 		 738 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  40.17 
 
 		 719 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  40.99 
 
 		 710 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  40.83 
 
 		 727 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  40.63 
 
 		 751 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  40.3 
 
 		 723 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  40.74 
 
 		 717 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  40.53 
 
 		 719 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  38.92 
 
 		 745 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>