71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0097 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0097  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  350  5e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.284387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1006  protein of unknown function DUF1697  57.56 
 
 
174 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2327  hypothetical protein  42.11 
 
 
181 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1764  hypothetical protein  36.53 
 
 
180 aa  104  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1387  hypothetical protein  32.95 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0176326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1268  protein of unknown function DUF1697  32.95 
 
 
180 aa  98.6  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1050  hypothetical protein  33.13 
 
 
183 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1652  protein of unknown function DUF1697  31.33 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0262317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1574  protein of unknown function DUF1697  30.72 
 
 
179 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2296  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5780  hypothetical protein  30.41 
 
 
183 aa  87  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.776481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0986  protein of unknown function DUF1697  34.09 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0859  protein of unknown function DUF1697  31.79 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.508227 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0125  protein of unknown function DUF1697  38.54 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2570  protein of unknown function DUF1697  47.13 
 
 
184 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3316  hypothetical protein  29.71 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547905  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1076  hypothetical protein  30.51 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0049  hypothetical protein  29.71 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0598  hypothetical protein  28.09 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3895  protein of unknown function DUF1697  38.64 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.547846  normal  0.243704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4009  protein of unknown function DUF1697  38.64 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0709322  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5447  hypothetical protein  31.62 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04955  hypothetical protein  34.04 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2796  hypothetical protein  42.53 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.255726  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2556  hypothetical protein  42.53 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2477  hypothetical protein  42.53 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00147015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2742  hypothetical protein  42.53 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.339272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2750  hypothetical protein  42.53 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000420555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4791  protein of unknown function DUF1697  36.96 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2548  hypothetical protein  31.18 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2349  hypothetical protein  37.93 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2585  protein of unknown function DUF1697  32.77 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.643987  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2754  hypothetical protein  40.23 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2775  hypothetical protein  39.08 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000631538  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2096  protein of unknown function DUF1697  27.37 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0639212  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2140  protein of unknown function DUF1697  40 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2538  hypothetical protein  39.08 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000984258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2258  protein of unknown function DUF1697  29.82 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2030  protein of unknown function DUF1697  27.68 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0740176  hitchhiker  0.00584791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2992  protein of unknown function DUF1697  31.87 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3789  hypothetical protein  26.59 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0516  hypothetical protein  27.38 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.260379  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2933  hypothetical protein  39.24 
 
 
179 aa  61.6  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.488628  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4434  hypothetical protein  25.66 
 
 
159 aa  61.6  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.823074  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4583  hypothetical protein  27.06 
 
 
172 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3525  hypothetical protein  42.22 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2470  protein of unknown function DUF1697  38.55 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.110184  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3173  hypothetical protein  27.43 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0323444  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1422  hypothetical protein  37.04 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1495  protein of unknown function DUF1697  22.75 
 
 
181 aa  57.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0351955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4288  hypothetical protein  32.18 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1395  hypothetical protein  43.04 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.751897 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2417  protein of unknown function DUF1697  28.16 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4323  hypothetical protein  27.84 
 
 
195 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4833  protein of unknown function DUF1697  34.07 
 
 
181 aa  54.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0683278  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2772  protein of unknown function DUF1697  36.36 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.223972  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2521  hypothetical protein  25.86 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1298  hypothetical protein  32.94 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4134  hypothetical protein  35.62 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.901726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11178  hypothetical protein  27.37 
 
 
213 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4059  hypothetical protein  35.62 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1846  protein of unknown function DUF1697  24.42 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111817  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0591  hypothetical protein  25.88 
 
 
179 aa  51.2  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2046  protein of unknown function DUF1697  23.49 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1661  hypothetical protein  48.94 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4577  protein of unknown function DUF1697  29.76 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1053  hypothetical protein  28.41 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3366  hypothetical protein  31.11 
 
 
179 aa  44.3  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0461169  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12770  hypothetical protein  26.36 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.296317  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26880  hypothetical protein  35.56 
 
 
190 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196788  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2489  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  42  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0786308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>