More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0092 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 492 aa  1011    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 460 aa  441  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0613  cysteinyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.618315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02459  cysteinyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 457 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2381  cysteinyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 493 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5013  cysteinyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90332  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 470 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0229  cysteinyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 510 aa  372  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.063419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6692  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 481 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 785 aa  362  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 484 aa  361  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 468 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0349  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 527 aa  355  1e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.382318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 493 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 484 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 472 aa  353  5e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 483 aa  350  5e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 459 aa  349  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 487 aa  349  6e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 469 aa  349  7e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 484 aa  349  8e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 480 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 481 aa  346  5e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 490 aa  344  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 479 aa  343  4e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 475 aa  343  5e-93  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 494 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 480 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 459 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 465 aa  341  2e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 465 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 481 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 455 aa  338  9.999999999999999e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 466 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 466 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 484 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 505 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 476 aa  336  5e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 459 aa  336  5e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 470 aa  336  5e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 485 aa  336  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 481 aa  336  7e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 465 aa  335  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 459 aa  335  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 456 aa  333  3e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 461 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 459 aa  334  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 465 aa  333  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 455 aa  333  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 461 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 461 aa  332  9e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 493 aa  332  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 477 aa  331  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 459 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 459 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 476 aa  330  4e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 461 aa  330  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 487 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 461 aa  330  5.0000000000000004e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 459 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 454 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 461 aa  327  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  39.16 
 
 		 461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 466 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 465 aa  326  5e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 461 aa  326  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>