More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0083 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0083  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
476 aa  974    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0519  GTP-binding protein EngA  40.87 
 
 
433 aa  322  9.000000000000001e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  38.12 
 
 
439 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  37.89 
 
 
441 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  38.29 
 
 
440 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  38.01 
 
 
440 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  38.06 
 
 
440 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  38.11 
 
 
440 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  37.16 
 
 
439 aa  297  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  37.59 
 
 
444 aa  296  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  37.78 
 
 
449 aa  296  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  38.26 
 
 
441 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  39.09 
 
 
438 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  36.78 
 
 
434 aa  293  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  38.58 
 
 
439 aa  293  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 
438 aa  292  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2356  GTP-binding protein EngA  36.53 
 
 
437 aa  289  7e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  38.11 
 
 
439 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  37.64 
 
 
438 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  38.36 
 
 
448 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  37.47 
 
 
441 aa  288  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  37.59 
 
 
441 aa  286  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  36.14 
 
 
435 aa  285  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.1 
 
 
438 aa  285  9e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1651  GTP-binding protein EngA  35.62 
 
 
443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0400  GTP-binding protein EngA  36.67 
 
 
436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.758155  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  37.9 
 
 
446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  38.07 
 
 
448 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  39.68 
 
 
438 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  36.34 
 
 
434 aa  280  5e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5226  ribosome-associated GTPase EngA  37.7 
 
 
435 aa  279  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.814163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  36.95 
 
 
436 aa  279  9e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0421  GTP-binding protein EngA  34.7 
 
 
437 aa  278  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0613118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  35.6 
 
 
438 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  37.01 
 
 
436 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  36.45 
 
 
441 aa  277  3e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  36.9 
 
 
442 aa  277  3e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  35.23 
 
 
438 aa  276  6e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  36.78 
 
 
436 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  36.78 
 
 
436 aa  276  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  36.78 
 
 
436 aa  276  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  36.78 
 
 
436 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  36.78 
 
 
436 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  36.78 
 
 
436 aa  276  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  36.78 
 
 
436 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  35.86 
 
 
436 aa  276  9e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  34.7 
 
 
440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  35.63 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  36.55 
 
 
436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  35.88 
 
 
436 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  36.34 
 
 
436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  36.34 
 
 
436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6542  small GTP-binding protein  36.47 
 
 
441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1422  ribosome-associated GTPase EngA  35.11 
 
 
484 aa  273  5.000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  37.12 
 
 
433 aa  273  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  34.26 
 
 
495 aa  273  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0490  small GTP-binding protein  36.2 
 
 
429 aa  272  8.000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3073  GTP-binding protein EngA  34.79 
 
 
435 aa  271  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.348074  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  35.65 
 
 
436 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  36.09 
 
 
436 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2013  GTP-binding protein EngA  35.62 
 
 
437 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  33.56 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  35.27 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1369  GTP-binding protein EngA  34.95 
 
 
434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.911808  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  34.97 
 
 
427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  35.41 
 
 
465 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1813  GTP-binding protein EngA  35.39 
 
 
436 aa  270  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.18548  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3857  small GTP-binding protein  34.86 
 
 
436 aa  270  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000791891  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  35.52 
 
 
444 aa  269  7e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  36.72 
 
 
440 aa  269  8.999999999999999e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  36.63 
 
 
455 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  34.98 
 
 
465 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  35.41 
 
 
465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  35.19 
 
 
443 aa  266  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  35.48 
 
 
441 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  34.93 
 
 
437 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  34.4 
 
 
437 aa  264  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  35.1 
 
 
455 aa  264  3e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  34.74 
 
 
455 aa  261  3e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 
438 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 
438 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  35.97 
 
 
441 aa  261  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  36.61 
 
 
445 aa  259  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  35.39 
 
 
458 aa  259  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  34.51 
 
 
456 aa  258  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  34.23 
 
 
456 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0426  GTP-binding protein EngA  34.83 
 
 
442 aa  258  2e-67  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000271389  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  33.55 
 
 
471 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  35.46 
 
 
494 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  34.29 
 
 
461 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  36.28 
 
 
602 aa  256  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  34.24 
 
 
463 aa  256  6e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2143  GTP-binding protein EngA  34.79 
 
 
437 aa  256  7e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  35.68 
 
 
493 aa  256  9e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  36.01 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  34 
 
 
442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  34.18 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  32.89 
 
 
460 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  33.48 
 
 
436 aa  254  3e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1617  GTP-binding protein EngA  35.9 
 
 
460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>