21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0081 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0081  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  943    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2077  hypothetical protein  29.46 
 
 		 982 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1399  Ribosomal small subunit Rsm22  32.32 
 
 		 973 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2712  hypothetical protein  28.29 
 
 		 576 aa  167  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1834  hypothetical protein  28.86 
 
 		 659 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1586  hypothetical protein  27.37 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4032  methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 321 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.541283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2693  ribosomal small subunit Rsm22  24.84 
 
 		 326 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000108375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1193  hypothetical protein  25.77 
 
 		 327 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1532  Ribosomal small subunit Rsm22  31.46 
 
 		 336 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3231  methyltransferase type 12  30.26 
 
 		 356 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4984  Ribosomal small subunit Rsm22  24.76 
 
 		 322 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2609  hypothetical protein  29.41 
 
 		 348 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782998  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4375  hypothetical protein  23.53 
 
 		 321 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.0519493 
 
 
-
 
NC_004310  BR1574  hypothetical protein  26.94 
 
 		 321 aa  48.9  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1520  hypothetical protein  26.94 
 
 		 321 aa  48.9  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2135  Ribosomal small subunit Rsm22  30.16 
 
 		 332 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1065  hypothetical protein  30.16 
 
 		 327 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  30.59 
 
 		 318 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1138  ribosomal small subunit Rsm22  23.16 
 
 		 354 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.169783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1591  ribosomal small subunit Rsm22  25.53 
 
 		 323 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0197095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>