141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0076 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0076  aldolase  100 
 
 
265 aa  538  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  36.68 
 
 
258 aa  155  7e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  34.07 
 
 
272 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  32.2 
 
 
271 aa  135  9e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  33.59 
 
 
263 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  34.24 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.7 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  31.42 
 
 
270 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  32.2 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  31.8 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  32.58 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  33.08 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  33.46 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  32.2 
 
 
272 aa  126  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  30.77 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  32.93 
 
 
264 aa  125  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  32.68 
 
 
261 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  32.44 
 
 
263 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  31 
 
 
271 aa  123  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.239509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  31.58 
 
 
265 aa  122  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  31.56 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  31.75 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.26 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  30.92 
 
 
331 aa  118  9e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  29.77 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  30.86 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  29 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  30.86 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  29.39 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  29.62 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  28.63 
 
 
266 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  29.62 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.73 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  32.7 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  29.77 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  29.77 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  29.5 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  29.48 
 
 
268 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  30.3 
 
 
293 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  27.34 
 
 
267 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  31.34 
 
 
295 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  30 
 
 
293 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  27 
 
 
265 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  28.08 
 
 
271 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  30.22 
 
 
293 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  30.22 
 
 
293 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  29.01 
 
 
267 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  30.3 
 
 
293 aa  106  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  28.79 
 
 
260 aa  105  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  31.3 
 
 
295 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  30.17 
 
 
257 aa  105  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  30.04 
 
 
293 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  27.59 
 
 
268 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  30.15 
 
 
293 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  31.92 
 
 
293 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  27.92 
 
 
267 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0399  aldolase  29.89 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.08 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2776  aldolase  27.03 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.21432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2771  aldolase  27.03 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2982  aldolase  27.03 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2983  aldolase  27.03 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2259  aldolase  27.03 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0573247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3021  aldolase  27.03 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2979  aldolase  27.03 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139976 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2700  aldolase  27.03 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161141  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  28.41 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  27.07 
 
 
293 aa  95.9  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  30.15 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  31 
 
 
272 aa  95.9  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  28.46 
 
 
294 aa  95.9  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  26.64 
 
 
260 aa  95.5  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3019  aldolase  26.25 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1655  aldolase  29.62 
 
 
291 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5482  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.03 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231333 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  25 
 
 
280 aa  90.1  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5219  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.03 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.639725 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  29.62 
 
 
291 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  28.79 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  29.23 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  29.23 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2141  aldolase  29.23 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2130  aldolase  29.23 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01474  hypothetical protein  29.23 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  28.08 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01485  hypothetical protein  29.23 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.09 
 
 
267 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4407  aldolase  28.74 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4409  aldolase  28.74 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4294  aldolase  28.74 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.78019  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4324  aldolase  28.74 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4477  aldolase  28.74 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3078  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.6 
 
 
280 aa  85.1  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39201  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2531  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  26.64 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  27.2 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  27.2 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  27.21 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  27.2 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5160  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.26 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543239  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  26.67 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>