More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0067 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0067  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
415 aa  863    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  30.21 
 
 
215 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  30.21 
 
 
215 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.73 
 
 
215 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  30.37 
 
 
219 aa  104  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2773  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.52 
 
 
395 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0528627  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0098  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.77 
 
 
211 aa  97.1  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.4392599999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
230 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
230 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.13 
 
 
225 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 
228 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
225 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.72 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.72 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0097  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120969  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  27.84 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.88 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.89 
 
 
226 aa  77  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
224 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.06 
 
 
228 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.07 
 
 
225 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.11 
 
 
225 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.54 
 
 
226 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.16 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.32 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  26.29 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  25.7 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  27.69 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.6 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.27 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.77 
 
 
225 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.4 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 
226 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
236 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  35.96 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.47 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.84 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.24 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  34.19 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  25 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.28 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.26 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.76 
 
 
230 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
236 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  26.67 
 
 
225 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  24.4 
 
 
225 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  25.52 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.27 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.47 
 
 
228 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.74 
 
 
171 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.77 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.11 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0291  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
227 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.94 
 
 
235 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.87 
 
 
224 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.94 
 
 
235 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.32 
 
 
232 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
228 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.77 
 
 
236 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.34 
 
 
248 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
227 aa  64.3  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  26.88 
 
 
227 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.74 
 
 
229 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
247 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.01 
 
 
425 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.58 
 
 
243 aa  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  33.01 
 
 
425 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  36.27 
 
 
237 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 
435 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.12 
 
 
226 aa  63.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.12 
 
 
227 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
219 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.63 
 
 
219 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
227 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
229 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  25.87 
 
 
225 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
233 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
225 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.63 
 
 
231 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.44 
 
 
230 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  24.06 
 
 
212 aa  60.1  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.67 
 
 
227 aa  60.1  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.06 
 
 
235 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  32.77 
 
 
214 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>