274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0061 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0061  fic family protein  100 
 
 		 348 aa  718    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3993  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.96 
 
 		 353 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.284344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  42.95 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2548  hypothetical protein  42.04 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3636  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.14 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0834  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.83 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.73 
 
 		 349 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.73 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24620  hypothetical protein  30.14 
 
 		 346 aa  165  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.996918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2034  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.76 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.54 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  31.14 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.86 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.16 
 
 		 349 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  33.99 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.84 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3513  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.04 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0831  AsnC family regulatory protein  31.58 
 
 		 349 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1710  hypothetical protein  25.8 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2342  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.35 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0305415  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  23.03 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  23.03 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  26.59 
 
 		 377 aa  85.9  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.27 
 
 		 367 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.93 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.12 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  32.41 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  27.31 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  26.83 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1455  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.67 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184885  normal  0.0996953 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  26.26 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  24.16 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.2 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.5 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.2 
 
 		 502 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  27.63 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  26.74 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.77 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0095  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.15 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.5 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.69 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3916  Fic family protein  30.35 
 
 		 431 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4959  Fic family protein  30.35 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2116  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.28 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4175  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.1 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.09 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0055  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.86 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0125874  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.3 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1889  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.67 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.21 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  24.06 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  27.23 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.22 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.48 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.84 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  24.35 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2238  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.2 
 
 		 485 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.76756  decreased coverage  0.000875847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.62 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.33 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1262  hypothetical protein  27.63 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.254788  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  27.15 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.21 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.15 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1532  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.1 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4789  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.42 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1081  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.87 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.32 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.91 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.64 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  25.23 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  24.68 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.52 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.31 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.88 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.88 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.04 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.64 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.38 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.64 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  26.83 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1912  putative MloA protein  27.2 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0664  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.34 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0557891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.89 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2915  hypothetical protein  30.46 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  26.94 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  26.11 
 
 		 429 aa  62.8  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.73 
 
 		 384 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0896  Fic family protein  29.55 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3867  hypothetical protein  29.55 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777828  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3441  hypothetical protein  30.46 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0623  hypothetical protein  25.84 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0951  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.55 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.48 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.62 
 
 		 250 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.27 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.69 
 
 		 372 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.24 
 
 		 384 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.35 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.14 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>