55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0058 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  97.27 
 
 		 280 aa  236  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0058  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  233  6e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  64.22 
 
 		 281 aa  170  7.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C09  transcription activator effector binding domain-containing protein  58.18 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  53.57 
 
 		 282 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0423  hypothetical protein  34.91 
 
 		 132 aa  76.6  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  26.36 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  32.71 
 
 		 279 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 300 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 300 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 300 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  30.1 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 291 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 291 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 313 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 279 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 290 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 277 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 287 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 290 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  24.29 
 
 		 290 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  22.86 
 
 		 290 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 290 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 290 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 281 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 271 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  22.86 
 
 		 290 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3219  transcription activator effector binding  32.35 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 292 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 279 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  31.37 
 
 		 302 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2510  hypothetical protein  25.93 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2461  hypothetical protein  25.93 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  23.4 
 
 		 288 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  24.27 
 
 		 158 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  23.3 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  25.96 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  25.96 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  26.92 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  25.96 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  23.3 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>