More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0051 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0051  alcohol dehydrogenase, iron-containing  100 
 
 
383 aa  775    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1642  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.18 
 
 
383 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  22.19 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.19 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.93 
 
 
400 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  22.19 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  22.98 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  21.93 
 
 
400 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  22.19 
 
 
400 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  22.05 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.22 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  22.82 
 
 
400 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.51 
 
 
381 aa  90.5  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.79 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 
385 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  23.72 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.54 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.19 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.74 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  22.68 
 
 
872 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.62 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.68 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0202  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.46 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.98 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  20.94 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  23.85 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.13 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  23.08 
 
 
385 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  21.99 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  22.63 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.56 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  23.28 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  23.85 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  23.85 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.85 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.71 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  23.85 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  23.85 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  23.85 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  23.85 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  23.85 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2495  lactaldehyde reductase  24.65 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.32 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.85 
 
 
387 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1421  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.21 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.9 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  23.41 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  22.45 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.11 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  21.65 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3534  alcohol dehydrogenase, iron-containing  22.83 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.63 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.13 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.13 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549318  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  22.14 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.17 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.92 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.62 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  22.14 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0145  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.86 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  22.14 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3116  L-1,2-propanediol oxidoreductase  22.19 
 
 
382 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.303713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  22.14 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  22.17 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  22.14 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  22.19 
 
 
382 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  22.14 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  22.19 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.17 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.59 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  21.93 
 
 
383 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  21.2 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  22.14 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0330  iron-containing alcohol dehydrogenase  19.79 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.397984 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  22.14 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  23.3 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  21.93 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.61 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.22 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2942  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.07 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204686  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  22.66 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.08 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.59 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  22.05 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3325  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.56 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.34 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.2 
 
 
384 aa  69.3  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1050  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.19 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  22.33 
 
 
382 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.32 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2733  putative alcohol dehydrogenase  20.27 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0334328  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  23.97 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  22.01 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  19.52 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.161806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2828  ethanolamine utilization protein EutG  24.66 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.56 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  19.62 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2654  ethanolamine utilization protein EutG  24.66 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0517138  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.03 
 
 
387 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2695  ethanolamine utilization protein EutG  24.66 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>