More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0047 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0047  imidazolonepropionase  100 
 
 
413 aa  847    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  51.7 
 
 
428 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  51.53 
 
 
424 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3678  imidazolonepropionase  52.62 
 
 
423 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.439583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3440  imidazolonepropionase  52.88 
 
 
423 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3403  imidazolonepropionase  52.88 
 
 
423 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3710  imidazolonepropionase  52.88 
 
 
423 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.11084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3660  imidazolonepropionase  52.88 
 
 
423 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3683  imidazolonepropionase  52.88 
 
 
423 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0019435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3758  imidazolonepropionase  52.62 
 
 
423 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3352  imidazolonepropionase  52.88 
 
 
423 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3337  imidazolonepropionase  52.36 
 
 
423 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.310939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1558  imidazolonepropionase  52.62 
 
 
423 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240138  normal  0.0370079 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2310  imidazolonepropionase  52.22 
 
 
423 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.299843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  50.9 
 
 
424 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2817  imidazolonepropionase  50.39 
 
 
423 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2355  imidazolonepropionase  47.37 
 
 
412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2398  imidazolonepropionase  47.37 
 
 
412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  45.62 
 
 
423 aa  334  2e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0914  imidazolonepropionase  45.67 
 
 
414 aa  330  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1291  imidazolonepropionase  48.32 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.563644  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0655  imidazolonepropionase  44.41 
 
 
413 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0607  imidazolonepropionase  44.16 
 
 
427 aa  316  5e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4041  imidazolonepropionase  43.68 
 
 
405 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  40.96 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  41.49 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  41.49 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  41.49 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  40.96 
 
 
410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  40.96 
 
 
408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  40.69 
 
 
408 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  42.55 
 
 
410 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  41.64 
 
 
408 aa  300  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  41.53 
 
 
410 aa  300  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  40.43 
 
 
408 aa  300  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1659  imidazolonepropionase  42.01 
 
 
427 aa  299  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  40.69 
 
 
408 aa  296  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2377  imidazolonepropionase  39.85 
 
 
424 aa  296  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887652  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  41.64 
 
 
408 aa  295  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  39.95 
 
 
412 aa  293  5e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4570  imidazolonepropionase  39.42 
 
 
411 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  42.71 
 
 
403 aa  290  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  39.01 
 
 
418 aa  288  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  40.32 
 
 
408 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  40.2 
 
 
414 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  41.07 
 
 
399 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  42.08 
 
 
401 aa  279  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0766  imidazolonepropionase  40.21 
 
 
403 aa  279  8e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  40.74 
 
 
415 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  40.48 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  41.03 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  38.64 
 
 
414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  39.68 
 
 
406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1507  imidazolonepropionase  37.84 
 
 
421 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0585  imidazolonepropionase  44.73 
 
 
415 aa  273  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0748  imidazolonepropionase  39.42 
 
 
403 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  40.17 
 
 
407 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4551  imidazolonepropionase  40.74 
 
 
402 aa  272  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  39.21 
 
 
411 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1049  imidazolonepropionase  37.53 
 
 
429 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0280969  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1436  imidazolonepropionase  40.59 
 
 
405 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  40.46 
 
 
407 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  40.46 
 
 
407 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  40.46 
 
 
407 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  41.47 
 
 
400 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  40.21 
 
 
401 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  39.73 
 
 
401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1260  imidazolonepropionase  40.23 
 
 
418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2448  imidazolonepropionase  37.84 
 
 
421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  40.16 
 
 
408 aa  270  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  41.03 
 
 
406 aa  270  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  37.85 
 
 
403 aa  270  5e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  40.46 
 
 
407 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  37.78 
 
 
421 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  40.46 
 
 
407 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2316  imidazolonepropionase  38.77 
 
 
426 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.0796073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  39.41 
 
 
401 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0164  imidazolonepropionase  38.5 
 
 
416 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  40.76 
 
 
406 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  38.68 
 
 
411 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2961  imidazolonepropionase  39.1 
 
 
416 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281832  normal  0.765672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  39.41 
 
 
401 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0929  imidazolonepropionase  41.45 
 
 
405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  41.99 
 
 
404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  41.21 
 
 
401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  39.41 
 
 
401 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  40.52 
 
 
407 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  40.52 
 
 
407 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  40.52 
 
 
407 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  40.52 
 
 
407 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  40.52 
 
 
407 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0825  imidazolonepropionase  38.75 
 
 
402 aa  266  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  36.94 
 
 
411 aa  266  5.999999999999999e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  40.52 
 
 
407 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  40.52 
 
 
407 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  38.34 
 
 
425 aa  266  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2986  imidazolonepropionase  40.11 
 
 
417 aa  266  7e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2512  imidazolonepropionase  40.49 
 
 
406 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0955381 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0823  imidazolonepropionase  37.13 
 
 
407 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0851  imidazolonepropionase  37.38 
 
 
420 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>