115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0043 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0043  TPR domain-containing protein  100 
 
 
627 aa  1286    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.81 
 
 
725 aa  79  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 
562 aa  66.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.9 
 
 
1737 aa  64.3  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 
4079 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.85 
 
 
1676 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
2262 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 
1069 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  26.59 
 
 
699 aa  58.5  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
395 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.48 
 
 
1067 aa  57.8  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 
750 aa  57.4  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  30.28 
 
 
545 aa  57  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.92 
 
 
576 aa  57  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 
566 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
1694 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  30.28 
 
 
587 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.4 
 
 
689 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
313 aa  54.7  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 
393 aa  55.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
448 aa  54.3  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 
931 aa  53.5  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
544 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 
375 aa  52.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
329 aa  52.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  21.16 
 
 
522 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
615 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.6 
 
 
557 aa  52.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.98 
 
 
639 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.52 
 
 
883 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.34 
 
 
389 aa  52.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  23.05 
 
 
299 aa  52  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.3 
 
 
738 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1557  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.74 
 
 
390 aa  51.2  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
2262 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  20.32 
 
 
810 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.31 
 
 
1138 aa  50.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  21.2 
 
 
436 aa  50.4  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  20.45 
 
 
878 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  18.81 
 
 
2240 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
405 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
279 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.74 
 
 
620 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.94 
 
 
1486 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.49 
 
 
887 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  21.16 
 
 
522 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  20.21 
 
 
409 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.27 
 
 
927 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  26.33 
 
 
444 aa  48.9  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 
402 aa  48.9  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.47 
 
 
222 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
377 aa  48.5  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
620 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 
565 aa  48.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 
3301 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 
944 aa  48.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.15 
 
 
1979 aa  47.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 
471 aa  47.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 
1297 aa  47.8  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  21.45 
 
 
409 aa  47.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
1450 aa  47.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
634 aa  47.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  21.02 
 
 
520 aa  47.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
399 aa  47.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  21.18 
 
 
632 aa  47.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 
886 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0888  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
761 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
567 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  21.53 
 
 
804 aa  47  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
265 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  20.91 
 
 
1276 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.96 
 
 
884 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0592  TPR repeat-containing pilus assembly protein PilF  26.25 
 
 
261 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83159  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3364  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 
234 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
337 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 
245 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  22.01 
 
 
936 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
687 aa  46.6  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
389 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0523  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
631 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0179552  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3446  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 
234 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.59 
 
 
784 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
344 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.28 
 
 
373 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3510  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 
234 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.429554  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  27.27 
 
 
269 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.78 
 
 
344 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4306  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
174 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  27.17 
 
 
395 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  27.67 
 
 
729 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.14 
 
 
745 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 
250 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 
376 aa  45.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  21.13 
 
 
577 aa  45.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  23.3 
 
 
379 aa  45.1  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 
465 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  20.73 
 
 
577 aa  44.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.16 
 
 
676 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
673 aa  44.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  41.07 
 
 
1161 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>