More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0033 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0033  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 239 aa  486  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00150761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3118  LytTR family two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259319  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  33.05 
 
 		 236 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02240  response regulator of the LytR/AlgR family  29.36 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  32.19 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0486  DNA-binding response regulator  31.76 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0347807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  31.47 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1167  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.77 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.91 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2646  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.96 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2345  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.77 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.681344 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.75 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0583  response regulator  32 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1600  LytTR family two component transcriptional regulator  30.86 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0468  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.78 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2791  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.35 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0891261 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0428  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.33 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.472628  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  27.08 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1679  LytTR family two component transcriptional regulator  30 
 
 		 238 aa  95.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 246 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  28.49 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12140  response regulator of the LytR/AlgR family  26.47 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  26.13 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.44 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  25 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2425  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.56 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0991  LytTR family two component transcriptional regulator  32.4 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  26.36 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1844  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.52 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  24.38 
 
 		 254 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  28.72 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  27.09 
 
 		 246 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  26.69 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  26.69 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  26.69 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  26.69 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0974  LytTR family two component transcriptional regulator  29.55 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.118297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  25.9 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  26.69 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  26.69 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3377  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.6 
 
 		 319 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  26.29 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  33.15 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  26.29 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  29.94 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.89 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3628  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.57 
 
 		 235 aa  85.1  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0184746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.88 
 
 		 281 aa  85.1  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1697  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.52 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.325505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4084  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.78 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.445273  normal  0.0209217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2060  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.9 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2165  LytTR family two component transcriptional regulator  26.44 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0607611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1723  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.02 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1834  LytTR family two component transcriptional regulator  28.09 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4564  LytTR family two component transcriptional regulator  25.11 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.35 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  24.74 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  23.56 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2575  two-component response regulator  28.69 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1841  response regulator receiver  26.16 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216203 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  24.15 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4189  LytTr DNA-binding region  29.71 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3124  LytTr DNA-binding region  30.15 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0498  LytTR family two component transcriptional regulator  34.87 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1177  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.9 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2270  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.22 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.31 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.43 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6125  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.04 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4710  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.67 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.75 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.73 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0577  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.67 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  27.11 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.42 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3280  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.9 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  28.24 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.24 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0330  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.32 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  28.24 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4129  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.58 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3172  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.43 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00901875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0597  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.39 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0722811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0388  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.4 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5133  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.44 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01640  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.17 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1047  LytTr DNA-binding region  28.15 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.791092  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  26.94 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  27.92 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0444  response regulator receiver protein  23.58 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2242  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.05 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2766  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.24 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6983  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.32 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1113  LytR/AlgR family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.29087 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.35 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3686  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.41 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0826  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.95 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.398179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0733  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.61 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>