106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0032 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0032  histidine kinase-related ATPase, putative  100 
 
 
248 aa  500  1e-141  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  7.37644e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  43.35 
 
 
342 aa  197  1e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853672  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0499  sensor histidine kinase  31 
 
 
431 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.46195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2269  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.22 
 
 
442 aa  92  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2545  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.89 
 
 
361 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.290644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0975  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0487  sensor histidine kinase  32.52 
 
 
431 aa  85.5  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0885624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2424  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.33 
 
 
423 aa  84.7  1e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0582  signal transduction protein  29.47 
 
 
431 aa  83.2  3e-15  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30 
 
 
445 aa  82  7e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.27922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.5 
 
 
456 aa  81.3  1e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.283788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2641  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.35 
 
 
423 aa  79  8e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02250  histidine kinase  25.47 
 
 
450 aa  78.6  9e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2647  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.36 
 
 
426 aa  76.3  5e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1601  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.01 
 
 
446 aa  73.2  3e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00658825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2346  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.6 
 
 
609 aa  72.8  4e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.600899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1751  sensor histidine kinase VirS  27.5 
 
 
440 aa  71.6  1e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0035916  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0745  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.8 
 
 
460 aa  70.9  2e-11  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0499  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.03 
 
 
287 aa  70.1  3e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000111074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0471  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.25 
 
 
225 aa  70.1  4e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0687563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2769  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.87 
 
 
303 aa  68.6  9e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0469  ATP-binding region ATPase domain protein  27 
 
 
444 aa  68.6  9e-11  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1481  sensor histidine kinase VirS  27 
 
 
441 aa  68.6  1e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.61061e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.27 
 
 
280 aa  66.6  4e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01630  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.99 
 
 
325 aa  64.3  2e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.41 
 
 
456 aa  62.8  5e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  7.28956e-05 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.89 
 
 
479 aa  62.4  7e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0430  ATP-binding region ATPase domain protein  22.38 
 
 
313 aa  61.2  1e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.57774e-05 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1570  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.54 
 
 
278 aa  61.2  2e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  6.77983e-15 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1579  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.49 
 
 
277 aa  60.5  2e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000246185  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1870  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.57 
 
 
470 aa  59.7  4e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  3.1179e-08  normal  0.169965 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3457  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.02 
 
 
443 aa  57  3e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1311  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.04 
 
 
443 aa  56.2  4e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.766434  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0538  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.52 
 
 
290 aa  56.2  5e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2632  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.17 
 
 
291 aa  54.7  2e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1650  signal transduction protein  25.1 
 
 
446 aa  54.3  2e-06  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1622  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.15 
 
 
275 aa  52.8  5e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.69 
 
 
430 aa  52.4  6e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  26.27 
 
 
528 aa  51.2  1e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0009  signal transduction protein  27.66 
 
 
277 aa  51.6  1e-05  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  24.74 
 
 
534 aa  51.2  2e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.23 
 
 
531 aa  49.7  4e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.23 
 
 
241 aa  49.3  5e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2224  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.32 
 
 
541 aa  49.3  5e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.691075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.57 
 
 
532 aa  49.3  5e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2790  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.7 
 
 
547 aa  49.3  6e-05  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000273411  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  25.68 
 
 
534 aa  48.5  9e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0928  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.59 
 
 
537 aa  48.5  9e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  25.68 
 
 
534 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  25.14 
 
 
534 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0938  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.59 
 
 
537 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.101589 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  25.68 
 
 
534 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0511  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.68 
 
 
521 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0671541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  25.68 
 
 
534 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3432  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.59 
 
 
537 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3096  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.59 
 
 
537 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.59 
 
 
537 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  25.14 
 
 
534 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3902  sensory histidine kinase DcuS  25.35 
 
 
543 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3005  histidine kinase domain protein  25.91 
 
 
406 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19029e-07 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0516  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.84 
 
 
551 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.494756  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  25 
 
 
543 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  25.68 
 
 
534 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4679  sensory histidine kinase DcuS  25.35 
 
 
543 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.35 
 
 
543 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0876  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.14 
 
 
537 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  25.35 
 
 
543 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  25 
 
 
543 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  25.14 
 
 
534 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1041  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.12 
 
 
563 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  25 
 
 
543 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  25.35 
 
 
543 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4650  sensory histidine kinase DcuS  25 
 
 
543 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.4 
 
 
556 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.05 
 
 
543 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1749  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.82 
 
 
534 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000244457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  24.73 
 
 
553 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.77 
 
 
529 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633378  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4366  sensory histidine kinase DcuS  25.35 
 
 
543 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.206477  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1492  accessory gene regulator protein C  27.94 
 
 
429 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.108947  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4567  sensory histidine kinase DcuS  25 
 
 
543 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2744  histidine kinase  24.21 
 
 
438 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00108764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2724  sensor histidine kinase  24.21 
 
 
438 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276945  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4196  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
680 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0175164 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0385  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  19.5 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.14 
 
 
524 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2021  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.38 
 
 
534 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.33 
 
 
536 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.43 
 
 
527 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0784  sensor kinase DpiB  24.19 
 
 
553 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636686  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  25.36 
 
 
537 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0740  sensor kinase DpiB  24.19 
 
 
553 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4697  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.04 
 
 
527 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269439  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0666  sensor kinase DpiB  24.19 
 
 
553 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3043  histidine kinase domain-containing protein  24.21 
 
 
438 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.795869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.68 
 
 
642 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  23.72 
 
 
529 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  27.27 
 
 
542 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3007  histidine kinase domain-containing protein  24.21 
 
 
438 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5077  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.35 
 
 
558 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.669392 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>