44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0026 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  100 
 
 		 396 aa  799    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  42.97 
 
 		 403 aa  349  6e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  43.19 
 
 		 390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  38.54 
 
 		 390 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  41.62 
 
 		 387 aa  301  9e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  37.11 
 
 		 392 aa  299  5e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  39.27 
 
 		 404 aa  285  8e-76  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  38.52 
 
 		 391 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  34.29 
 
 		 401 aa  256  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  37.14 
 
 		 404 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  34.96 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  33.16 
 
 		 399 aa  246  6e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  36.51 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  36.34 
 
 		 400 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  37.01 
 
 		 410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  34.72 
 
 		 393 aa  229  8e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  34.68 
 
 		 405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  35.7 
 
 		 404 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  34.65 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  34.81 
 
 		 461 aa  219  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  35.2 
 
 		 517 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  35.45 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  34.66 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  33.33 
 
 		 406 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  34.3 
 
 		 380 aa  206  8e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  34.91 
 
 		 398 aa  203  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  32.89 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  33.42 
 
 		 402 aa  189  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  32.89 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  33.93 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  30.61 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  38.33 
 
 		 243 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  42.5 
 
 		 603 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  31.14 
 
 		 452 aa  106  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  37.5 
 
 		 523 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  30.57 
 
 		 374 aa  102  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  41.04 
 
 		 499 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  30.47 
 
 		 265 aa  96.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  30.7 
 
 		 221 aa  95.5  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  38.98 
 
 		 629 aa  92.8  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  38.14 
 
 		 589 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  30.09 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  34.35 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48468  predicted protein  24.52 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>