23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0018 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0018  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  328  3e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000125361  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  35.85 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  52 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  35.85 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.55 
 
 		 233 aa  47.4  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  46.15 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  34.41 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  34.41 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0490  peptidoglycan-binding LysM  32 
 
 		 291 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860962  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  46.15 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  42.31 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  46.15 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  34.41 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  39.34 
 
 		 156 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  40 
 
 		 456 aa  41.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  33.03 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  31.78 
 
 		 1082 aa  41.2  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  39.34 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  31.82 
 
 		 228 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  39.34 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  39.34 
 
 		 156 aa  40.8  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>