More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0893 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0893  60 kDa chaperonin  100 
 
 		 534 aa  1088    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00498028  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  29.79 
 
 		 542 aa  239  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  30.4 
 
 		 539 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  30.48 
 
 		 549 aa  234  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5849  chaperonin GroEL  30.16 
 
 		 542 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1331  chaperonin GroEL  31.58 
 
 		 547 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  29.88 
 
 		 544 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  30.86 
 
 		 550 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  30.16 
 
 		 540 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  30.66 
 
 		 550 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  29.77 
 
 		 542 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5038  chaperonin GroEL  29.03 
 
 		 542 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.473372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1771  chaperonin GroEL  30.23 
 
 		 545 aa  227  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190882  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  28.52 
 
 		 545 aa  225  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1671  chaperonin GroEL  30.08 
 
 		 547 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0795  chaperonin GroEL  31.24 
 
 		 547 aa  225  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0673  chaperonin GroEL  30.04 
 
 		 545 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916463  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  29.96 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5830  chaperonin GroEL  28.4 
 
 		 547 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109675  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1738  chaperonin GroEL  30.37 
 
 		 548 aa  223  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.280539  decreased coverage  0.00152275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  29.03 
 
 		 542 aa  223  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0534  chaperonin GroEL  30.36 
 
 		 546 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6084  chaperonin GroEL  28.99 
 
 		 545 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1767  chaperonin GroEL  29.71 
 
 		 548 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0408  chaperonin GroEL  29.18 
 
 		 545 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.522888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4150  chaperonin GroEL  28.99 
 
 		 548 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00153421  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7830  chaperonin GroEL  30.36 
 
 		 549 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  27.93 
 
 		 546 aa  220  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  28.49 
 
 		 550 aa  219  7e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0271  chaperonin GroEL  29.15 
 
 		 547 aa  220  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  28.52 
 
 		 548 aa  219  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5285  chaperonin GroEL  28.12 
 
 		 546 aa  219  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.361226 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  28.88 
 
 		 547 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  28.91 
 
 		 544 aa  218  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4726  chaperonin GroEL  29.63 
 
 		 551 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  28.88 
 
 		 547 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0386  chaperonin GroEL  28.68 
 
 		 544 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0411403  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4782  chaperonin GroEL  30.04 
 
 		 546 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5249  chaperonin GroEL  30.04 
 
 		 546 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0470  chaperonin GroEL  28.6 
 
 		 547 aa  217  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3659  chaperonin GroEL  30.16 
 
 		 540 aa  217  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3196  chaperonin GroEL  30.9 
 
 		 545 aa  217  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0515  chaperonin GroEL  28.6 
 
 		 547 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.128762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1166  chaperonin GroEL  29.77 
 
 		 548 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.89242  normal  0.956764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4264  chaperonin GroEL  28.6 
 
 		 543 aa  216  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154167  normal  0.0469061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5325  chaperonin GroEL  29.98 
 
 		 546 aa  216  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0804  chaperonin GroEL  28.07 
 
 		 542 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451933  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2189  chaperonin GroEL  28.68 
 
 		 546 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2521  60 kDa chaperonin (protein Cpn60)  29.34 
 
 		 541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3334  chaperonin GroEL  30.16 
 
 		 540 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2457  chaperonin GroEL  28.52 
 
 		 545 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0741  chaperonin GroEL  29.75 
 
 		 548 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5580  chaperonin GroEL  29.6 
 
 		 546 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3026  chaperonin GroEL  29.38 
 
 		 546 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0195  chaperonin GroEL  29.18 
 
 		 546 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2919  chaperonin GroEL  27.82 
 
 		 547 aa  213  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  28.98 
 
 		 542 aa  213  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  29.01 
 
 		 545 aa  213  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  29.01 
 
 		 545 aa  213  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2227  chaperonin GroEL  28.85 
 
 		 547 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182713  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  29.21 
 
 		 543 aa  213  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5463  chaperonin GroEL  29.85 
 
 		 551 aa  213  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0295  chaperonin GroEL  27.68 
 
 		 551 aa  213  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.206807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0177  chaperonin GroEL  29.18 
 
 		 546 aa  212  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00120697  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1176  chaperonin GroEL  27.93 
 
 		 545 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.412382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1543  chaperonin GroEL  27.76 
 
 		 536 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0452  chaperonin GroEL  28.4 
 
 		 547 aa  211  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.992131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0984  chaperonin GroEL  29.12 
 
 		 545 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488332  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1044  chaperonin GroEL  30.26 
 
 		 544 aa  211  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3358  chaperonin GroEL  27.84 
 
 		 546 aa  210  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  29.03 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0317  chaperonin GroEL  28.27 
 
 		 544 aa  209  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000185818  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6589  chaperonin GroEL  28.21 
 
 		 554 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2524  chaperonin GroEL  29.3 
 
 		 539 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  27.82 
 
 		 547 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0035  chaperonin GroEL  28.6 
 
 		 547 aa  207  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0226788  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1623  chaperonin GroEL  28.09 
 
 		 547 aa  207  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757187  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  28.19 
 
 		 540 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  28.9 
 
 		 551 aa  206  7e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  28.49 
 
 		 549 aa  206  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  28.22 
 
 		 547 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  28.03 
 
 		 547 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0520  chaperonin GroEL  28.11 
 
 		 545 aa  206  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.156015 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  28.03 
 
 		 547 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4501  chaperonin GroEL  29.41 
 
 		 548 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356522  hitchhiker  0.00205266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3234  chaperonin GroEL  28.52 
 
 		 547 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.554891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3172  chaperonin GroEL  28.71 
 
 		 547 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  27.93 
 
 		 542 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  27.24 
 
 		 554 aa  204  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0680  chaperonin GroEL  28.25 
 
 		 549 aa  204  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.156157 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0638  chaperonin GroEL  27.47 
 
 		 548 aa  204  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  28.05 
 
 		 547 aa  203  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  28.6 
 
 		 545 aa  203  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2054  chaperonin GroEL  28.98 
 
 		 544 aa  203  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  28.1 
 
 		 545 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0957  chaperone protein GroEL  28.21 
 
 		 548 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10436  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4130  chaperonin GroEL  29.47 
 
 		 544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.800331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1089  chaperonin GroEL  28.38 
 
 		 545 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000383154  normal  0.0318123 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0861  chaperonin GroEL  30.18 
 
 		 541 aa  200  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00285794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  28.87 
 
 		 553 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>