More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0826 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0826  thioredoxin  100 
 
 
102 aa  206  8e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  49.48 
 
 
105 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  50 
 
 
104 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  50 
 
 
104 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  50 
 
 
104 aa  101  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  51.52 
 
 
110 aa  100  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  45.63 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  45.1 
 
 
104 aa  98.6  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  52.53 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  52.63 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  52.63 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  53.06 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  52.63 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  45.36 
 
 
104 aa  98.2  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  48.48 
 
 
112 aa  97.1  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  46.53 
 
 
106 aa  97.1  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  38 
 
 
104 aa  97.1  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  52.04 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41 
 
 
104 aa  96.7  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  44.9 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  53.57 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  47.96 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  45.1 
 
 
102 aa  95.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  50 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  36.63 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  41.18 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  51.25 
 
 
104 aa  94  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  43.88 
 
 
104 aa  94  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  44 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  92  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  46.94 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  50 
 
 
120 aa  92  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  46.46 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  50.53 
 
 
108 aa  92  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  38.61 
 
 
103 aa  92  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  42.86 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  46.43 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  54.32 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  46.46 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  38 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  45.92 
 
 
110 aa  90.5  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  47.57 
 
 
108 aa  90.1  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  48 
 
 
108 aa  90.1  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  51.85 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  55 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  40.82 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  52.38 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  44.55 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  54.88 
 
 
106 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  49.46 
 
 
108 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  45.92 
 
 
106 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3221  thioredoxin  46.39 
 
 
104 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  49.46 
 
 
108 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  53.66 
 
 
106 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  49.46 
 
 
108 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  40.59 
 
 
113 aa  89.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  45.74 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  44 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  50 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  41.67 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  47.42 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  46.6 
 
 
108 aa  88.2  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  45.26 
 
 
115 aa  87.8  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  43.56 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  41.58 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  46.43 
 
 
259 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  44.9 
 
 
106 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  44.12 
 
 
109 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  43.75 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  41 
 
 
108 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  37.5 
 
 
106 aa  88.2  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  42.57 
 
 
109 aa  87.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4649  thioredoxin  49.48 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4648  thioredoxin  49.48 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  47.42 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4417  thioredoxin  49.48 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4256  thioredoxin  49.48 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4268  thioredoxin  49.48 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  50 
 
 
110 aa  87.4  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  47.42 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4629  thioredoxin  49.48 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0273149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4758  thioredoxin  49.48 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  42.11 
 
 
238 aa  87.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  50.62 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4633  thioredoxin  49.48 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0606  thioredoxin  49.48 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  47.62 
 
 
107 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  37.62 
 
 
136 aa  87  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  45.24 
 
 
107 aa  87  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  43 
 
 
107 aa  87.4  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  43.3 
 
 
101 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  46.43 
 
 
107 aa  87  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  48.84 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  46.94 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  42 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  43.88 
 
 
106 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  44.9 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>