More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0804 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0804  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 111 aa  222  1e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000495791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  41.49 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  47.78 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  44.83 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  45.98 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  47.56 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  47.56 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  52.31 
 
 		 80 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1957  ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  43.68 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  44.68 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  45.98 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  41.11 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  49.23 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  45.98 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  47.56 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  40.86 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  48 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3656  50S ribosomal protein L24  55.74 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000160911  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  50.79 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  40.86 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  52.31 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  49.23 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  42.53 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  40.86 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  46.84 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  38.54 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  41.38 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  43.68 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  43.68 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  41.18 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  43.68 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  43.68 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  43.68 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  43.68 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  43.68 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  44.32 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0942  50S ribosomal protein L24  38.53 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  43.68 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  44.32 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  44.83 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  43.68 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  50.77 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  49.23 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000749977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  42.86 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  42.11 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0095  50S ribosomal protein L24  49.32 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.713288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  47.13 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  42.53 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  39.53 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1022  50S ribosomal protein L24  53.97 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000323194  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  40.21 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  45.07 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  40.21 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  42.17 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1766  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000967663  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  43.84 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0573  50S ribosomal protein L24  40.48 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1357  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00374615  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  42.05 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  39.08 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  43.96 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  42.35 
 
 		 100 aa  60.1  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0300  50S ribosomal protein L24  44.62 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5776  ribosomal protein L24  37.5 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0501804  normal  0.536525 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1639  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17541  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  40 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  37.93 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  39.08 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1118  50S ribosomal protein L24  49.23 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1097  Ribosomal protein L24-like protein  39.53 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16671  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  40.7 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1693  50S ribosomal protein L24  53.97 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0105327  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1864  50S ribosomal protein L24  53.97 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0297  50S ribosomal protein L24  48.44 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00211526  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0064  50S ribosomal protein L24  36.73 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000643332  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17291  50S ribosomal protein L24  45.59 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0061  50S ribosomal protein L24  37.76 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000762997  hitchhiker  1.34485e-17 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0380  50S ribosomal protein L24  53.52 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  37.78 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  42.5 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  41.86 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  46.38 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17381  50S ribosomal protein L24  45.59 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0405  50S ribosomal protein L24  53.52 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1840  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0647015  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  47.83 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  53.03 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  43.68 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  39.58 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  37.78 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  38.78 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  42.35 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0260  50S ribosomal protein L24  46.99 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0016412  hitchhiker  0.00832042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>