More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0800 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0800  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
123 aa  244  3e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00718139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  51.67 
 
 
134 aa  113  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  44.07 
 
 
119 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  44.35 
 
 
124 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 
120 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0704  ribosomal protein L18  45.67 
 
 
127 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815408  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2672  ribosomal protein L18  44.83 
 
 
127 aa  104  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  43.22 
 
 
119 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  49.11 
 
 
122 aa  103  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 
120 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 
120 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  49.11 
 
 
120 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
120 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  50.45 
 
 
119 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  48.62 
 
 
134 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  43.1 
 
 
127 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  48.48 
 
 
121 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  45.38 
 
 
122 aa  100  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17010  LSU ribosomal protein L18P  43.97 
 
 
124 aa  100  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000838424  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  46.55 
 
 
127 aa  100  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  49.11 
 
 
120 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  49.11 
 
 
120 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  42.02 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  49.11 
 
 
118 aa  99.4  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  42.98 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  47.75 
 
 
120 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  49.11 
 
 
120 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1201  50S ribosomal protein L18  48.6 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0426216 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  42.86 
 
 
122 aa  98.2  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  48.65 
 
 
120 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  51.89 
 
 
117 aa  97.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  45.45 
 
 
121 aa  97.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  47.5 
 
 
127 aa  97.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  45.45 
 
 
124 aa  97.1  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2241  50S ribosomal protein L18  46.53 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.272684  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  41.46 
 
 
119 aa  97.1  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  39.84 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  48.18 
 
 
120 aa  96.7  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  41.23 
 
 
128 aa  95.9  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  44.92 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  38.98 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  45.69 
 
 
118 aa  95.1  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  43.97 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  43.59 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  46.85 
 
 
112 aa  94.7  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  46.36 
 
 
112 aa  94.7  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  44.44 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  42.24 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
120 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  43.97 
 
 
120 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  43.97 
 
 
120 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  43.97 
 
 
120 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  43.97 
 
 
123 aa  94  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  45.45 
 
 
123 aa  94  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
120 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  43.1 
 
 
119 aa  93.6  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  41.96 
 
 
122 aa  93.6  9e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  41.8 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  46.96 
 
 
125 aa  93.6  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  47.75 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  43.97 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  43.97 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  43.97 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  43.97 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  43.97 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  43.97 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  43.97 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  43.59 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  45.79 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2603  50S ribosomal protein L18  47.27 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000566812  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  47.75 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  44.26 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  42.86 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  42.37 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  42.52 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0095  50S ribosomal protein L18  46.46 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0507743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  44.83 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  41.94 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  44.14 
 
 
120 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23640  LSU ribosomal protein L18P  45.45 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  43.64 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0564  50S ribosomal protein L18  49.47 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  42.24 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  42.24 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  44.55 
 
 
119 aa  91.3  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  43.97 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  45.13 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  44.64 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  42.06 
 
 
128 aa  90.5  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  42.86 
 
 
117 aa  90.5  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  48.42 
 
 
120 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  48.42 
 
 
120 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  42.98 
 
 
137 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  42.73 
 
 
120 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  42.73 
 
 
120 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2202  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
120 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0988305  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  46.15 
 
 
122 aa  89.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  45.13 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  46.15 
 
 
122 aa  89.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>