More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0796 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0796  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000812257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 125 aa  140  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 124 aa  140  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 125 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 125 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  53.66 
 
 		 123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 123 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 123 aa  137  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 125 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1169  ribosomal protein S13  55.28 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2036  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.818597  normal  0.51135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  55 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  52.89 
 
 		 121 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_002936  DET0499  30S ribosomal protein S13  54.17 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000323492  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  54.7 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0331  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 125 aa  133  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  54.17 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 123 aa  132  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1393  ribosomal protein S13  51.61 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 121 aa  131  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1930  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  52.46 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  50.82 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2179  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.980549  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2457  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  53.28 
 
 		 122 aa  130  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2142  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 122 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  50.82 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2989  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.183417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2194  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 122 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5048  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 122 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0590197  normal  0.99624 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 122 aa  130  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 124 aa  129  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 125 aa  129  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  52.46 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  51.67 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  51.67 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  50 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  52.46 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  52.46 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  50.41 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0204  30S ribosomal protein S13  52.94 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  48.76 
 
 		 123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 122 aa  127  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  51.67 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  50.82 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  49.18 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  48.36 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  51.67 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>