More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0730 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 506 aa  1052    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 493 aa  478  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 494 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 493 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 493 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 493 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 509 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 514 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 509 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 493 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 493 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 493 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 503 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 494 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 489 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 493 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 494 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 493 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 484 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 488 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 492 aa  412  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 504 aa  405  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 504 aa  388  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 492 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 506 aa  368  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 479 aa  368  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 476 aa  365  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 502 aa  362  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 500 aa  361  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 486 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 502 aa  359  8e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 502 aa  358  9e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 490 aa  355  6.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 502 aa  353  4e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 495 aa  352  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 490 aa  350  5e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 491 aa  349  9e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 484 aa  347  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 504 aa  347  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 493 aa  347  3e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 464 aa  347  4e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 485 aa  342  7e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 464 aa  342  8e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  39.18 
 
 		 495 aa  342  8e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 494 aa  341  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 503 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 503 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 487 aa  339  7e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 480 aa  335  9e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 484 aa  333  5e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 479 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 498 aa  330  4e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 516 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 490 aa  327  5e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 507 aa  326  6e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 490 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 482 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 473 aa  324  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 484 aa  323  4e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 512 aa  322  7e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 489 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 485 aa  321  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 488 aa  319  6e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 500 aa  319  6e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 492 aa  319  7e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 503 aa  319  9e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 484 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 484 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 510 aa  316  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 488 aa  316  8e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 501 aa  314  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 491 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 469 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 491 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 504 aa  312  7.999999999999999e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 491 aa  312  9e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 496 aa  312  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 467 aa  311  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 517 aa  311  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 535 aa  310  5e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 		 501 aa  310  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 463 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01030  Glutamyl-tRNA synthetase, putative  45.58 
 
 		 588 aa  309  6.999999999999999e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.116915  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 506 aa  309  8e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>