More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0714 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0714  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 269 aa  556  1e-157  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  33.08 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  32.51 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  31.73 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  38.89 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  32.83 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  31.7 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  36.16 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  33.46 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  33.59 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  33.78 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  31.2 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  36.09 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  33.58 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  34.55 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  34.05 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  35.4 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  32.31 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  30.74 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  32.9 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  32.9 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  29.89 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  35.24 
 
 		 258 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  31.52 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  30.77 
 
 		 355 aa  112  9e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  31.32 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  32.62 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  29.26 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  30.83 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  28.15 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  28.15 
 
 		 288 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  28.15 
 
 		 288 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  28.15 
 
 		 288 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  34.21 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  36.02 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  31.3 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  28.15 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  29.56 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  28.15 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  32.9 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  28.15 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  28.15 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  30.8 
 
 		 284 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  31.34 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  31.22 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  30.26 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  31.42 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  31.43 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  33.48 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  31.07 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  32.76 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  32.08 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  32.61 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  30.1 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  28.52 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  32.13 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  32.35 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1771  diaminopimelate epimerase  33.18 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  30.18 
 
 		 281 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  33.05 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  31.6 
 
 		 304 aa  99  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  32.22 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  30 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  30.58 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  32.62 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  32.76 
 
 		 292 aa  97.1  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  37.14 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  30.38 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  34.8 
 
 		 277 aa  95.5  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  32.31 
 
 		 280 aa  95.5  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  30.45 
 
 		 299 aa  95.5  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  29.45 
 
 		 279 aa  95.1  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  29.75 
 
 		 286 aa  95.5  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  30.29 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  36.67 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  30.04 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  30.04 
 
 		 249 aa  94  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  30.91 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  32.38 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1874  diaminopimelate epimerase  29.84 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0107  diaminopimelate epimerase  30.04 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  30.36 
 
 		 286 aa  92.4  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  30.26 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  29.88 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  30.04 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0348  diaminopimelate epimerase  32.28 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  26.77 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1416  diaminopimelate epimerase  30.59 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1270  diaminopimelate epimerase  30.59 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000437124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  27.74 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 		 290 aa  89.7  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  31.32 
 
 		 279 aa  89.4  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>