More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0669 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0669  L,L-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 
393 aa  811    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22909  predicted protein  42.72 
 
 
443 aa  322  6e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30412  predicted protein  41.85 
 
 
402 aa  318  9e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00618284  normal  0.581125 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1014  L,L-diaminopimelate aminotransferase  41.98 
 
 
409 aa  313  4.999999999999999e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2324  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.84 
 
 
409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00770  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.54 
 
 
424 aa  306  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.386201  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4142  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.15 
 
 
411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0162  L,L-diaminopimelate aminotransferase  41.13 
 
 
410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19411  L,L-diaminopimelate aminotransferase  42.47 
 
 
408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16911  L,L-diaminopimelate aminotransferase  41.13 
 
 
408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4052  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.39 
 
 
411 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1066  L,L-diaminopimelate aminotransferase  42.01 
 
 
408 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3061  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.15 
 
 
410 aa  300  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2423  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.73 
 
 
410 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4564  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40 
 
 
411 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1185  L,L-diaminopimelate aminotransferase  41.18 
 
 
531 aa  299  4e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0213  L,L-diaminopimelate aminotransferase  41.13 
 
 
410 aa  299  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0427359  hitchhiker  0.00000000000342652 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.15 
 
 
408 aa  299  7e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.118927  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1351  L,L-diaminopimelate aminotransferase  38.71 
 
 
407 aa  295  8e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0206949  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3040  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.89 
 
 
410 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1592  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.39 
 
 
408 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.518523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0238  L,L-diaminopimelate aminotransferase  39.85 
 
 
410 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3995  aminotransferase class I and II  40.49 
 
 
411 aa  293  5e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16801  L,L-diaminopimelate aminotransferase  39.45 
 
 
408 aa  292  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0704  L,L-diaminopimelate aminotransferase  39.16 
 
 
407 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0631  L,L-diaminopimelate aminotransferase  39.45 
 
 
404 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.923394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2354  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.2 
 
 
411 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1424  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.95 
 
 
411 aa  289  5.0000000000000004e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.05 
 
 
408 aa  289  6e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0509  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.94 
 
 
411 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0494  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.94 
 
 
411 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0853  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.59 
 
 
411 aa  289  8e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217772  hitchhiker  0.00920973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4424  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.59 
 
 
411 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0886982 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3293  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.94 
 
 
411 aa  287  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.792404  decreased coverage  0.00697344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4059  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.2 
 
 
411 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1151  aminotransferase class I and II  39.21 
 
 
408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3101  L,L-diaminopimelate aminotransferase  39.11 
 
 
410 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0311  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.59 
 
 
408 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4620  L,L-diaminopimelate aminotransferase  38.27 
 
 
407 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2779  L,L-diaminopimelate aminotransferase  38.02 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0363182  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23741  L,L-diaminopimelate aminotransferase  39.85 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113284 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16221  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40 
 
 
408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516745  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  30.6 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  28.91 
 
 
390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  28.07 
 
 
406 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  28.68 
 
 
401 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  27.25 
 
 
392 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  27.79 
 
 
392 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  27.79 
 
 
392 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  27.79 
 
 
392 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  27.79 
 
 
392 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  28.31 
 
 
391 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  27.52 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  27.18 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  26.28 
 
 
399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  27.17 
 
 
392 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  26.65 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  28.03 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  27.25 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  27.48 
 
 
384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  26.28 
 
 
399 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.3 
 
 
388 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.3 
 
 
388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  27.42 
 
 
390 aa  116  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  29.04 
 
 
395 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  28.32 
 
 
382 aa  116  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  26.09 
 
 
399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.62 
 
 
392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  29.38 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  27.46 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  27.69 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  27.02 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  26.1 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07380  aminotransferase  27.9 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  26.33 
 
 
399 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  27.52 
 
 
392 aa  114  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.5 
 
 
388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.27 
 
 
389 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  28.46 
 
 
382 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  27.25 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0765  aminotransferase  28.35 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  27.25 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  27.25 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  27.48 
 
 
382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.87 
 
 
385 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  26.4 
 
 
399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  27.46 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  27.25 
 
 
399 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.99 
 
 
391 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  27.64 
 
 
383 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6544  aminotransferase class I and II  28.03 
 
 
403 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  26.82 
 
 
388 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  29.57 
 
 
383 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  26.55 
 
 
388 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  25.87 
 
 
380 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  25.79 
 
 
387 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  26.78 
 
 
393 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.15 
 
 
388 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  26.68 
 
 
393 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  25.06 
 
 
425 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>