258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0591 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0591  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
172 aa  347  6e-95  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00143535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  30.06 
 
 
176 aa  84.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  30.72 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  30.91 
 
 
183 aa  79  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  29.14 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  31.25 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  31.76 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  28.48 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  28.05 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  28.05 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  30.72 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  31.21 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  27.49 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  28.39 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  30.11 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  30.11 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  31.33 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  32.16 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  28.82 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  32.03 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  34.53 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  28.74 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  31.07 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  34.59 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  27.49 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  36.43 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  31.17 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  36.43 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  30.59 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  26.74 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  30.41 
 
 
173 aa  72  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  26.35 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  33.83 
 
 
175 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  26.74 
 
 
173 aa  72  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  33.08 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  26.67 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  30.06 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  31.93 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  25.15 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0256  50S ribosomal protein L10  32.87 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000651654  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  30.3 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  27.49 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  29.87 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000920712  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  31.36 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  27.49 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  29.24 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  29.41 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  27.17 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  26.9 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  28.16 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  28.28 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  29.48 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  26.9 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  30.54 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  29.76 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  26.9 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  30.67 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  28.24 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  28.79 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  28.4 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  30.3 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  23.53 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  28.03 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  28.4 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  32.7 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  28.21 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  30.43 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  25.31 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  28 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  27.38 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  30.92 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  26.11 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  30.61 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  29.66 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  25.88 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  25.81 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  29.14 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  29.24 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  28.85 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  27.38 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  28.65 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  27.74 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  33.33 
 
 
212 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 
172 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  28.65 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 
172 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>