More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0488 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  100 
 
 		 466 aa  936    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  37.42 
 
 		 467 aa  359  6e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  37.42 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  42.23 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  42.46 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  36.34 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  36.34 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  37.94 
 
 		 494 aa  313  4.999999999999999e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  35.78 
 
 		 480 aa  299  6e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  35.53 
 
 		 499 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  35.2 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  35.2 
 
 		 476 aa  290  3e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  32.96 
 
 		 473 aa  289  8e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  35.42 
 
 		 473 aa  289  9e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  35.42 
 
 		 473 aa  279  7e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  33.65 
 
 		 474 aa  276  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  32.32 
 
 		 506 aa  273  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  31.61 
 
 		 506 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  34.87 
 
 		 490 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  34.12 
 
 		 508 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  31.88 
 
 		 495 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  34.33 
 
 		 475 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  33.49 
 
 		 475 aa  256  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  33.11 
 
 		 503 aa  249  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  30.36 
 
 		 472 aa  226  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  30.36 
 
 		 472 aa  226  9e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  32.03 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.57 
 
 		 511 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  30.57 
 
 		 511 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  30.57 
 
 		 511 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  30.57 
 
 		 511 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.26 
 
 		 511 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  30.57 
 
 		 511 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.57 
 
 		 511 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.57 
 
 		 511 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.57 
 
 		 511 aa  217  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  29.44 
 
 		 485 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  29.22 
 
 		 485 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  28.32 
 
 		 473 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  28.32 
 
 		 473 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  28.32 
 
 		 473 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  28.32 
 
 		 473 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  28.32 
 
 		 473 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  30.16 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  29.93 
 
 		 445 aa  200  6e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  28.34 
 
 		 511 aa  183  6e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 720 aa  166  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  24.89 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  27.32 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 481 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  24.12 
 
 		 472 aa  110  6e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 500 aa  107  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  22.91 
 
 		 464 aa  103  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  24.58 
 
 		 495 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  24.58 
 
 		 495 aa  103  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 497 aa  99.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  23.35 
 
 		 476 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 500 aa  93.2  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0217  amino acid antiporter  25.59 
 
 		 782 aa  90.1  8e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 504 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 504 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 504 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  21.61 
 
 		 467 aa  87  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4126  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 		 502 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.635081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  22.45 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  22.22 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  26.21 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  25.75 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  23.26 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  23.98 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  23.98 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  23.98 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  23.98 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  23.98 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  25.45 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  22.26 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  24.79 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1880  amino acid transporter  25.29 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000114764  hitchhiker  0.000000000709791 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00903  predicted transporter  23.6 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2744  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397041  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1062  amino acid permease family protein  23.6 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2697  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  24.25 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52526 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00910  hypothetical protein  23.6 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  23.6 
 
 		 540 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  23.6 
 
 		 540 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1400  amino acid permease family protein  24.04 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00116878  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1212  amino acid permease yshA  24.59 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0367716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1671  arginine/ornithine antiporter  25.76 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3254  putrescine transporter  28.78 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2445  putrescine transporter  23.17 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273787  normal  0.196088 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1458  arginine/ornithine antiporter  25.54 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0071658  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  23.42 
 
 		 446 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  30.49 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 576 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 544 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3061  arginine/ornithine antiporter  25.34 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>