More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0481 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
806 aa  694    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 
802 aa  863    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
819 aa  1699    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
813 aa  660    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
824 aa  670    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
805 aa  816    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
858 aa  800    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 
804 aa  850    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
807 aa  694    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
804 aa  705    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 
802 aa  863    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
810 aa  706    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  50 
 
 
833 aa  826    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
856 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
859 aa  664    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
969 aa  668    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 
802 aa  862    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 
802 aa  863    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
801 aa  684    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 
802 aa  862    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
800 aa  691    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
823 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
823 aa  641    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
838 aa  885    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
865 aa  643    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 
805 aa  857    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
862 aa  641    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
878 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
954 aa  686    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
872 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
952 aa  680    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
840 aa  799    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
813 aa  653    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
851 aa  671    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 
802 aa  863    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
805 aa  807    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
884 aa  638    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
805 aa  823    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
875 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
824 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
806 aa  813    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
806 aa  803    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 
802 aa  862    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
805 aa  816    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
865 aa  696    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
856 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
804 aa  719    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
857 aa  772    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
829 aa  665    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 
802 aa  867    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
806 aa  815    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
904 aa  677    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  0.0000864885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 
802 aa  855    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08751  leucyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
872 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.115344  hitchhiker  0.00155899 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
805 aa  811    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
934 aa  682    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
936 aa  725    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 
802 aa  862    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
958 aa  687    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
978 aa  664    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
971 aa  696    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
814 aa  657    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
954 aa  654    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
824 aa  668    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 
862 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
904 aa  674    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
971 aa  696    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
824 aa  639    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
807 aa  828    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
949 aa  675    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
921 aa  692    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
816 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
816 aa  654    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
829 aa  638    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 
824 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
817 aa  671    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
824 aa  667    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
835 aa  761    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
857 aa  724    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
824 aa  664    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
1016 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
825 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  46.6 
 
 
879 aa  767    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 
829 aa  836    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
829 aa  760    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 
804 aa  816    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
808 aa  824    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 
833 aa  834    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 
802 aa  862    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  46.88 
 
 
899 aa  756    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
830 aa  652    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
968 aa  690    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
801 aa  760    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
968 aa  684    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
949 aa  669    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 
816 aa  808    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
829 aa  643    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
858 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
824 aa  668    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
971 aa  696    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>