More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0383 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
371 aa  768    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  35.57 
 
 
366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  37.11 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  35.61 
 
 
365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  36.18 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  34.42 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  35.43 
 
 
365 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  35.33 
 
 
365 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  35.33 
 
 
365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  35.69 
 
 
365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  35.33 
 
 
365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  36.09 
 
 
364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  35.43 
 
 
365 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.72 
 
 
368 aa  232  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  35.69 
 
 
365 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  35.59 
 
 
365 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  38.67 
 
 
388 aa  225  9e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  35.14 
 
 
434 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  41.9 
 
 
381 aa  222  9e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  42.57 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  37.35 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 
366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  37.34 
 
 
373 aa  212  7e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36 
 
 
360 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  34.06 
 
 
383 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  36.19 
 
 
351 aa  210  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  37.74 
 
 
386 aa  209  5e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  35.53 
 
 
373 aa  209  8e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  35.17 
 
 
374 aa  209  9e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  38.78 
 
 
354 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  36.65 
 
 
347 aa  206  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  38.52 
 
 
355 aa  207  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  36.79 
 
 
363 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  36.77 
 
 
349 aa  203  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  32.44 
 
 
352 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  35.74 
 
 
358 aa  202  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  31.43 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  36.25 
 
 
355 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  36.84 
 
 
345 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  36.84 
 
 
345 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  39.92 
 
 
350 aa  199  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  39.37 
 
 
382 aa  199  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  35.74 
 
 
358 aa  199  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4436  HhH-GPD family protein  42.08 
 
 
335 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.907069  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  35.95 
 
 
368 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  38.75 
 
 
344 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  35.6 
 
 
355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  33.78 
 
 
353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  34.75 
 
 
352 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  36.93 
 
 
353 aa  196  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2284  A/G-specific adenine glycosylase  37.63 
 
 
453 aa  196  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  36 
 
 
407 aa  196  7e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1984  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.71 
 
 
453 aa  196  7e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.328101  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  34.43 
 
 
352 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  36.54 
 
 
354 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  34.73 
 
 
386 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  41.6 
 
 
350 aa  193  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  34.97 
 
 
382 aa  193  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.38 
 
 
367 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.3 
 
 
372 aa  192  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  40.38 
 
 
367 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.17 
 
 
368 aa  192  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.77 
 
 
372 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  31.71 
 
 
368 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  38.13 
 
 
363 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  35.33 
 
 
370 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  34.04 
 
 
382 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  33.01 
 
 
352 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.3 
 
 
372 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  38.18 
 
 
383 aa  191  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.18 
 
 
361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  40.54 
 
 
358 aa  190  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  33.75 
 
 
350 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.48 
 
 
342 aa  190  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  37.35 
 
 
365 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  38.55 
 
 
357 aa  189  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  40.54 
 
 
358 aa  189  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  33.54 
 
 
350 aa  188  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  33.74 
 
 
382 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  38.55 
 
 
362 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  33.76 
 
 
354 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  38.61 
 
 
388 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.63 
 
 
344 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  37.3 
 
 
350 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  32.59 
 
 
362 aa  187  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  34.46 
 
 
350 aa  187  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.45 
 
 
345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  40.47 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  35.06 
 
 
370 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  37.3 
 
 
350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  32.79 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  32.79 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  32.79 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  32.79 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  32.79 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  37.3 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  32.59 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  32.59 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  37.3 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  32.79 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>