More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0366 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0366  type III secretion system protein  100 
 
 
360 aa  731    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  36 
 
 
349 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  34.73 
 
 
351 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  33.63 
 
 
369 aa  202  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.06 
 
 
356 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  33.52 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  34.82 
 
 
354 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.61 
 
 
360 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  31.9 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.94 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.91 
 
 
374 aa  178  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.62 
 
 
374 aa  177  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.46 
 
 
360 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  32.8 
 
 
349 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.05 
 
 
392 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  35.06 
 
 
345 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  31.96 
 
 
349 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.52 
 
 
390 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  31.69 
 
 
359 aa  169  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.02 
 
 
366 aa  169  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.85 
 
 
354 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.02 
 
 
362 aa  168  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  31.03 
 
 
355 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.02 
 
 
362 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0960  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.19 
 
 
384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.74 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  31.03 
 
 
356 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.05 
 
 
361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  31.03 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  30.35 
 
 
361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  33.71 
 
 
352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.44 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.59 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  31.44 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  31.44 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  33.71 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  31.16 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.65 
 
 
363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.88 
 
 
375 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.95 
 
 
357 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.43 
 
 
363 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.59 
 
 
381 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.81 
 
 
376 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  33.43 
 
 
352 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  33.43 
 
 
352 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  33.43 
 
 
352 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.65 
 
 
377 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.75 
 
 
406 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.04 
 
 
403 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.55 
 
 
353 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1749  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.73 
 
 
359 aa  159  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.14 
 
 
376 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  28.69 
 
 
377 aa  159  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  31.74 
 
 
349 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.66 
 
 
382 aa  159  9e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.41 
 
 
376 aa  159  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.66 
 
 
382 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.95 
 
 
376 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  32.17 
 
 
375 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.92 
 
 
363 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.02 
 
 
381 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.94 
 
 
353 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.82 
 
 
377 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.35 
 
 
355 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.78 
 
 
357 aa  157  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1205  type III secretion protein HrcU  30.75 
 
 
359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322672  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.92 
 
 
373 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.31 
 
 
351 aa  155  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 
376 aa  155  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.68 
 
 
354 aa  155  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.25 
 
 
377 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  32.57 
 
 
359 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3750  type III secretion exporter  30.46 
 
 
343 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.08 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.52 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1392  type III secretion protein HrcU  31.98 
 
 
359 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.03 
 
 
377 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2021  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 
360 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.73 
 
 
377 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.19 
 
 
366 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.01 
 
 
390 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.73 
 
 
378 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.86 
 
 
376 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0864  type III secretion system protein HrcU  31.34 
 
 
357 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479024 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06204  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.66 
 
 
376 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.29 
 
 
354 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.52 
 
 
359 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1735  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.15 
 
 
348 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.736219  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00962  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.66 
 
 
376 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.97 
 
 
377 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0849  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.61 
 
 
377 aa  149  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5440  type III secretion exporter  30.37 
 
 
343 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368429  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.28 
 
 
348 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1556  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.28 
 
 
348 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1545  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.28 
 
 
348 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1766  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.28 
 
 
348 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1715  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.28 
 
 
348 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  28.17 
 
 
359 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.32 
 
 
353 aa  149  8e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.4 
 
 
377 aa  149  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>