More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0231 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0231  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
89 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0167652  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2335  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2284  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  59.04 
 
 
84 aa  100  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  100  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  55.06 
 
 
89 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
90 aa  99.4  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
90 aa  99.4  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
87 aa  97.1  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2299  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3907  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  56.18 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  56.1 
 
 
88 aa  94.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 
89 aa  94.7  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  58.54 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  53.49 
 
 
88 aa  94.4  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0937  ribosomal protein S15  51.14 
 
 
90 aa  94.4  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 
89 aa  94  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  56.1 
 
 
88 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  56.1 
 
 
88 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  94  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  94  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  94  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  94  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
90 aa  94  7e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  94  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
90 aa  94  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  94  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  94  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  94  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  94  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  94  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  58.54 
 
 
88 aa  94  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  94  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  50.56 
 
 
89 aa  93.2  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0169  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  93.2  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.44341  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0726  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
91 aa  92.8  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000147654  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  54.88 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  52.81 
 
 
89 aa  92.8  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1718  ribosomal protein S15  56.1 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000241512  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
90 aa  92.8  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  92  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  56.47 
 
 
87 aa  92.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4651  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  92  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  50.56 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  52.44 
 
 
88 aa  90.9  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0634  ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  90.5  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  90.5  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
95 aa  90.1  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  53.66 
 
 
88 aa  89.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1606  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  51.72 
 
 
88 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3881  ribosomal protein S15  53.41 
 
 
90 aa  88.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 
89 aa  88.2  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1040  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000106655  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
87 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
87 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0782  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  87  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00988358  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  50.56 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  52.33 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0533  ribosomal protein S15  56.1 
 
 
87 aa  86.3  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>