96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0167 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0167  ribonuclease P  100 
 
 
119 aa  242  1e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00183081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  45.88 
 
 
116 aa  67.8  5e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  44.71 
 
 
116 aa  65.5  2e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  41.3 
 
 
116 aa  64.7  5e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  41.86 
 
 
121 aa  57.8  5e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  34.29 
 
 
113 aa  57.4  6e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  35.56 
 
 
114 aa  56.2  1e-07  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  34.44 
 
 
114 aa  53.9  7e-07  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  40 
 
 
119 aa  53.9  8e-07  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  40 
 
 
119 aa  53.9  8e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.96678e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  40 
 
 
119 aa  53.9  8e-07  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  40 
 
 
119 aa  53.9  8e-07  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.73614e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  53.9  8e-07  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  40 
 
 
119 aa  53.9  8e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  40 
 
 
119 aa  53.5  8e-07  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  38.46 
 
 
119 aa  53.5  1e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.9586e-09  unclonable  7.49508e-09 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  31.58 
 
 
121 aa  53.1  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  35.78 
 
 
118 aa  52.8  1e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  5.56747e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  40.22 
 
 
170 aa  52.4  2e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  40 
 
 
119 aa  52  3e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  38.95 
 
 
119 aa  51.6  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  38.95 
 
 
119 aa  51.6  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  38.95 
 
 
119 aa  51.6  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  5.99062e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  38.95 
 
 
119 aa  51.6  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  32.23 
 
 
130 aa  51.6  4e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  40 
 
 
119 aa  51.6  4e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  38.95 
 
 
119 aa  51.6  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  37.36 
 
 
120 aa  51.2  5e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  7.42435e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 
135 aa  50.8  6e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  31.43 
 
 
116 aa  50.8  7e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.75953e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  37.36 
 
 
120 aa  50.4  8e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  9.36038e-09  unclonable  6.97895e-11 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  34.19 
 
 
130 aa  50.4  9e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  33.68 
 
 
118 aa  49.7  1e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  33.93 
 
 
119 aa  50.1  1e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  33.63 
 
 
118 aa  50.1  1e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  6.76804e-10  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  38.95 
 
 
119 aa  49.7  1e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  33.68 
 
 
118 aa  49.3  2e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.1378e-08  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  33.68 
 
 
118 aa  49.3  2e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.90839e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  37.63 
 
 
120 aa  48.9  2e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  33.68 
 
 
118 aa  49.3  2e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.48711e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  33.68 
 
 
118 aa  49.3  2e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  7.94478e-11  unclonable  1.88803e-12 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  33.68 
 
 
118 aa  49.7  2e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.40717e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  33.68 
 
 
118 aa  48.9  3e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.19749e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  36.26 
 
 
120 aa  48.1  4e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.77263e-09  unclonable  2.45558e-06 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  31.43 
 
 
116 aa  48.1  4e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  32.63 
 
 
118 aa  48.1  5e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.39461e-09  unclonable  2.08872e-11 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  32.63 
 
 
118 aa  48.1  5e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  4.50646e-09  unclonable  3.97397e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  32.63 
 
 
118 aa  48.1  5e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  3.19179e-06  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  36.96 
 
 
119 aa  47.8  5e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  42.25 
 
 
87 aa  47.8  6e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  41.77 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  39.29 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  8.41875e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4291  ribonuclease P  38.1 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000762  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  35.42 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.00185e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  26.36 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  2.13724e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0134  ribonuclease P protein component  29.91 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0423414  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1229  ribonuclease P protein component  35.56 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0151351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  43.06 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3988  ribonuclease P protein component  34.52 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4464  ribonuclease P  34.52 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  45.76 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  42.55 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  2.04064e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  29.27 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  6.762e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  38.83 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  46.81 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  7.47963e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  46.81 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  41.67 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  37.68 
 
 
120 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 
180 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  30.36 
 
 
125 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  6.17506e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3100  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  4.56921e-05 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.71159e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  48.94 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.57593e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2826  ribonuclease P protein component  44.07 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3399  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  26.55 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  32.98 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  40.58 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0302  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0091  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3237  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.254569  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3552  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0105  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2239  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2846  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.752825  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  29.63 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  2.99838e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  40.62 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  1.66605e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  35.62 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  6.01305e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  35 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  32.95 
 
 
123 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  9.48284e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  32.58 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2390  ribonuclease P protein component  37.08 
 
 
130 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.02633e-08  hitchhiker  7.53131e-08 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>