More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0100 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0100  cation transporter E1-E2 family ATPase  100 
 
 
659 aa  1341    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  37.44 
 
 
734 aa  351  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43082  P-ATPase family transporter: cadmium ion  38.39 
 
 
632 aa  344  2e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0569828  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27426  P-ATPase family transporter: cadmium/zinc ion; heavy metal translocating P-type ATPase family-like protein  38.39 
 
 
997 aa  343  7e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.040121  normal  0.339459 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  35.11 
 
 
734 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  32.88 
 
 
712 aa  336  7e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  36.56 
 
 
640 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  32.47 
 
 
712 aa  335  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  34.55 
 
 
833 aa  333  6e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  35.06 
 
 
758 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  32 
 
 
712 aa  332  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  35.23 
 
 
713 aa  331  3e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  34.5 
 
 
740 aa  331  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3485  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
740 aa  330  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333666  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  36.19 
 
 
641 aa  329  9e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  34.63 
 
 
752 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  34.29 
 
 
740 aa  324  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  34.62 
 
 
750 aa  323  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  35.85 
 
 
738 aa  322  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  32.78 
 
 
1022 aa  321  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  35.49 
 
 
799 aa  320  6e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  33.6 
 
 
769 aa  319  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  32.91 
 
 
801 aa  319  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  36.44 
 
 
635 aa  319  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  33.88 
 
 
800 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  33.69 
 
 
675 aa  318  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  34.82 
 
 
711 aa  318  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
783 aa  318  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  32.9 
 
 
707 aa  316  9e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  36.19 
 
 
718 aa  316  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  33.92 
 
 
800 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  35.47 
 
 
830 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  33.61 
 
 
799 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  34.13 
 
 
748 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  33.76 
 
 
713 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  36.11 
 
 
640 aa  312  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000621697  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  36.78 
 
 
793 aa  311  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0041  heavy metal translocating P-type ATPase  34.36 
 
 
665 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  34.36 
 
 
665 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000377038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  34.36 
 
 
665 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  34.25 
 
 
750 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0058  heavy metal translocating P-type ATPase  34.36 
 
 
665 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
800 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 
737 aa  310  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
800 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
752 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  33.63 
 
 
723 aa  310  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  33.51 
 
 
750 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
750 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  34.63 
 
 
713 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  34.53 
 
 
835 aa  307  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  34.06 
 
 
701 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  35.41 
 
 
803 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  34 
 
 
799 aa  306  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4019  cadmium-translocating P-type ATPase  34.63 
 
 
832 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0927  heavy metal translocating P-type ATPase  32.15 
 
 
800 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.28162  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  34 
 
 
709 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  35.56 
 
 
639 aa  306  9.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1349  heavy metal translocating P-type ATPase  34.6 
 
 
698 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3564  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
785 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  32.45 
 
 
739 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3038  cadmium-translocating P-type ATPase  34.63 
 
 
834 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1563  cadmium-translocating P-type ATPase  34.63 
 
 
832 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0906  heavy metal translocating P-type ATPase  36.28 
 
 
712 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  35.02 
 
 
850 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3333  cadmium-translocating P-type ATPase  34.63 
 
 
834 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  31.94 
 
 
637 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  31.68 
 
 
750 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
809 aa  305  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0150  cadmium-translocating P-type ATPase  34.46 
 
 
713 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  33.77 
 
 
748 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1476  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  34.51 
 
 
647 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
984 aa  303  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
984 aa  303  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  35.53 
 
 
880 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  31.77 
 
 
709 aa  303  7.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 
861 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  32.87 
 
 
926 aa  302  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  33.44 
 
 
639 aa  302  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  34.69 
 
 
712 aa  302  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3946  cadmium-translocating P-type ATPase  34.63 
 
 
828 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3562  heavy metal translocating P-type ATPase  34.13 
 
 
762 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482767  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2344  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
732 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.442895  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  31.78 
 
 
767 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0127  heavy metal translocating P-type ATPase  34.15 
 
 
647 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  35.79 
 
 
720 aa  301  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  34.97 
 
 
744 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  33.96 
 
 
712 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  35.2 
 
 
778 aa  300  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  33.44 
 
 
834 aa  300  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0433  heavy metal translocating P-type ATPase  32.67 
 
 
786 aa  300  6e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  35.44 
 
 
709 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  33.39 
 
 
651 aa  300  6e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  33.18 
 
 
826 aa  300  7e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  32.99 
 
 
673 aa  300  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  36.38 
 
 
731 aa  300  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  35.07 
 
 
904 aa  299  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  34.57 
 
 
796 aa  299  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00827087  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  35.31 
 
 
738 aa  299  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  32.46 
 
 
800 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>