36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0093 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0093  NifU-related protein  100 
 
 
260 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.467374  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.7 
 
 
329 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  31.58 
 
 
333 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  32.04 
 
 
323 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  31.07 
 
 
323 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  21.23 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  28.04 
 
 
330 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  31.07 
 
 
323 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  31.07 
 
 
323 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  31.07 
 
 
324 aa  57  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  30.84 
 
 
330 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  28.97 
 
 
330 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  23.21 
 
 
277 aa  52  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  25.47 
 
 
293 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  29 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  33.33 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  21.95 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.95 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  25.47 
 
 
294 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  25.47 
 
 
294 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.3 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  28.3 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  23.31 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.72 
 
 
344 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.76 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  20.46 
 
 
277 aa  45.4  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  29.55 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  27.91 
 
 
137 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  25.47 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  26.42 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.31 
 
 
202 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.66 
 
 
283 aa  42.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  29.55 
 
 
190 aa  42.7  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  29.55 
 
 
190 aa  42.7  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0595  NifU domain-containing protein  27.55 
 
 
144 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  23.86 
 
 
186 aa  42  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>