More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0077 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  100 
 
 		 410 aa  829    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.85 
 
 		 464 aa  186  5e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  43.98 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1864  tRNA adenylyltransferase  33.93 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.3 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.67 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  44.91 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.61 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.34 
 
 		 464 aa  171  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.92 
 
 		 397 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  33.92 
 
 		 471 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.25 
 
 		 450 aa  169  6e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  43.48 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.35 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.99 
 
 		 397 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.17 
 
 		 397 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  44.23 
 
 		 402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.74 
 
 		 397 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.74 
 
 		 397 aa  166  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.74 
 
 		 397 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.74 
 
 		 397 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  40.93 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  39.81 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1462  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.6 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1419  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.74 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3753  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.32 
 
 		 397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  41.86 
 
 		 402 aa  162  8.000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  43.04 
 
 		 399 aa  162  9e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.89 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  43.84 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  42.27 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  42.64 
 
 		 436 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  42.64 
 
 		 436 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  42.64 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1495  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  37.18 
 
 		 423 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1488  Poly(A) polymerase (PAP) (plasmid copy number protein)  37.18 
 
 		 423 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.37 
 
 		 459 aa  155  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0963  poly(A) polymerase  36.91 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0830  Poly(A) polymerase  36.91 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715876  hitchhiker  0.000411869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4809  Poly(A) polymerase, PcnB  38.2 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814505  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  39.66 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6049  poly(A) polymerase  38.86 
 
 		 495 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.694866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4697  poly(A) polymerase  37.93 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  hitchhiker  0.0000455164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3590  poly(A) polymerase  37.34 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.787264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4562  poly(A) polymerase  37.93 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263697 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.74 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.74 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1654  tRNA cytidylyltransferase  43.33 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  39.04 
 
 		 410 aa  153  5e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0279  hypothetical protein  39.15 
 
 		 549 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3063  poly(A) polymerase  37.34 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  42.47 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0301  poly(A) polymerase  38.72 
 
 		 556 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0290  poly(A) polymerase  38.72 
 
 		 556 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1765  poly(A) polymerase  42.11 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4696  poly(A) polymerase  37.93 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3376  poly(A) polymerase  37.28 
 
 		 443 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000590256  normal  0.326432 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0303  poly(A) polymerase  38.89 
 
 		 548 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.203958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2762  poly(A) polymerase  38.18 
 
 		 456 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.860721  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0736  poly(A) polymerase  38.36 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305046 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1006  tRNA-nucleotidyltransferase  33.07 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.947871  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0882  Polynucleotide adenylyltransferase  35.87 
 
 		 465 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.5 
 
 		 473 aa  150  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5444  poly(A) polymerase  36.89 
 
 		 467 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62560  poly(A) polymerase  37.04 
 
 		 467 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0669  poly(A) polymerase  35.79 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.598779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42690  polynucleotide adenylyltransferase; PcnB  35.71 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.881175  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1390  poly(A) polymerase  35.04 
 
 		 424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3459  poly(A) polymerase  36.55 
 
 		 454 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000537308  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0691  poly(A) polymerase family protein  36.09 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0154  poly(A) polymerase I  36.55 
 
 		 454 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000110744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1480  poly(A) polymerase  40.67 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.976033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  38.99 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0134  poly(A) polymerase I  36.55 
 
 		 454 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0152  poly(A) polymerase I  36.55 
 
 		 454 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000005693  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00142  poly(A) polymerase I  36.55 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00002208  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3516  poly(A) polymerase I  36.55 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000476175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00141  hypothetical protein  36.55 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0218  poly(A) polymerase I  36.55 
 
 		 454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474344  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2050  poly(A) polymerase, PcnB  39.55 
 
 		 462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.187335 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0216  poly(A) polymerase I  36.55 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000405641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0201  poly(A) polymerase I  36.55 
 
 		 437 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000171206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0200  poly(A) polymerase I  36.55 
 
 		 437 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000820079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0147  poly(A) polymerase I  36.13 
 
 		 454 aa  146  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000759631  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0146  poly(A) polymerase I  36.13 
 
 		 454 aa  146  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2681200000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  38.91 
 
 		 424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1515  poly(A) polymerase  36.18 
 
 		 461 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0267914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  38.79 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0212  poly(A) polymerase I  32.78 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00291988  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  38.91 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  38.77 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0171  poly(A) polymerase  35.37 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0883  Poly(A) polymerase, PcnB  31.05 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0632296  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2821  poly(A) polymerase I  33 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00527466  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0195  polynucleotide adenyltransferase  35.37 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3182  Poly(A) polymerase, PcnB  38.07 
 
 		 447 aa  143  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2312  polyA polymerase  36.52 
 
 		 438 aa  143  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.049056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3101  poly(A) polymerase  39.81 
 
 		 442 aa  143  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.87683e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0675  poly(A) polymerase  36.08 
 
 		 498 aa  143  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0600  poly(A) polymerase  40.29 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>