More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0074 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  40.02 
 
 		 1120 aa  684    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  39.13 
 
 		 1117 aa  654    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 968 aa  2004    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  46.13 
 
 		 1117 aa  775    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  39.28 
 
 		 1113 aa  652    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  38.04 
 
 		 1114 aa  645    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  39.48 
 
 		 1118 aa  668    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  37.89 
 
 		 1130 aa  640    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  41.6 
 
 		 1029 aa  711    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  38.89 
 
 		 1116 aa  658    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  41.82 
 
 		 1024 aa  715    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  41.8 
 
 		 1017 aa  699    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  39.39 
 
 		 1102 aa  660    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  41.92 
 
 		 1027 aa  710    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  42.14 
 
 		 1024 aa  712    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  42.32 
 
 		 1031 aa  710    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  37.82 
 
 		 1118 aa  649    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  38.71 
 
 		 1114 aa  663    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  39.48 
 
 		 1136 aa  701    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  46.31 
 
 		 1004 aa  810    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  42.96 
 
 		 1022 aa  728    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  35.97 
 
 		 925 aa  510  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  46.71 
 
 		 834 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  43.39 
 
 		 864 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  45.97 
 
 		 863 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  45.62 
 
 		 857 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  43.79 
 
 		 862 aa  438  1e-121  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  43.22 
 
 		 862 aa  438  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  43.79 
 
 		 862 aa  438  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  45.47 
 
 		 869 aa  436  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  43.96 
 
 		 845 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  41.05 
 
 		 903 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  46.26 
 
 		 859 aa  435  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  43.22 
 
 		 868 aa  436  1e-120  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  43.85 
 
 		 855 aa  435  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  44 
 
 		 886 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  45.93 
 
 		 844 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  41.29 
 
 		 912 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2917  preprotein translocase subunit SecA  43.4 
 
 		 895 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0194  preprotein translocase subunit SecA  44.14 
 
 		 931 aa  429  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  45.63 
 
 		 858 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  43.7 
 
 		 884 aa  432  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  43.9 
 
 		 848 aa  429  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  43.24 
 
 		 866 aa  427  1e-118  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  41.91 
 
 		 897 aa  426  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  42.19 
 
 		 842 aa  425  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  43.16 
 
 		 840 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  43.2 
 
 		 845 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  43.45 
 
 		 908 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  46.35 
 
 		 833 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  45.13 
 
 		 796 aa  422  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  43.45 
 
 		 908 aa  422  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  41.72 
 
 		 907 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  43.09 
 
 		 888 aa  422  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  43.45 
 
 		 908 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  43.98 
 
 		 830 aa  420  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  43.45 
 
 		 908 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  40.91 
 
 		 1009 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  43.26 
 
 		 908 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  42.91 
 
 		 836 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  43.26 
 
 		 911 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  43.93 
 
 		 902 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1169  preprotein translocase subunit SecA  43.99 
 
 		 908 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  41.75 
 
 		 896 aa  418  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1871  preprotein translocase subunit SecA  42.3 
 
 		 906 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  42.51 
 
 		 907 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2831  preprotein translocase subunit SecA  43.53 
 
 		 908 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.125346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  41.64 
 
 		 909 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  42.35 
 
 		 881 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  43.26 
 
 		 909 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  43.26 
 
 		 908 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  43.45 
 
 		 908 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  43.26 
 
 		 908 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  43.68 
 
 		 840 aa  419  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  44.27 
 
 		 859 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1021  preprotein translocase subunit SecA  42.63 
 
 		 906 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  42.12 
 
 		 906 aa  415  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  41.99 
 
 		 914 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  40.66 
 
 		 899 aa  415  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2191  preprotein translocase, SecA subunit  42.15 
 
 		 928 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  41.71 
 
 		 907 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  40.8 
 
 		 902 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  43.36 
 
 		 906 aa  416  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0863  preprotein translocase subunit SecA  45.19 
 
 		 824 aa  415  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0619112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2246  preprotein translocase subunit SecA  40.62 
 
 		 939 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  41.99 
 
 		 914 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  41.54 
 
 		 896 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  42.72 
 
 		 897 aa  415  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  43.47 
 
 		 897 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  42.77 
 
 		 835 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  43.1 
 
 		 925 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  42.77 
 
 		 835 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  40.6 
 
 		 917 aa  412  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  41.8 
 
 		 896 aa  412  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1220  preprotein translocase subunit SecA  41.77 
 
 		 916 aa  413  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  40.72 
 
 		 917 aa  413  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  42.16 
 
 		 908 aa  413  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  42.97 
 
 		 835 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1241  preprotein translocase subunit SecA  42.91 
 
 		 871 aa  413  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00118655  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2761  preprotein translocase subunit SecA  42.7 
 
 		 906 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>