More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0069 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0069  endonuclease III  100 
 
 		 210 aa  431  1e-120  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  46.15 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  45.13 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  43.78 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  45.63 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.91 
 
 		 218 aa  164  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.07 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  42.93 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  43.69 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  46.55 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  42.64 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  42.13 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  41.67 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  43.27 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  42.57 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  41.62 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  40.59 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.86 
 
 		 231 aa  144  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  42.08 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  34.95 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  40 
 
 		 217 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  39.47 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  39.81 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  38.5 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  37.81 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  37.7 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  36.22 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  38.92 
 
 		 224 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  36.55 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  35.98 
 
 		 223 aa  128  8.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  38.54 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  39.58 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  35.61 
 
 		 224 aa  125  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  35.57 
 
 		 238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.9 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  35.53 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  38.27 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  35.78 
 
 		 220 aa  124  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  36.63 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  35.41 
 
 		 224 aa  124  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.92 
 
 		 263 aa  124  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  34.01 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  34.6 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  35.58 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  33.33 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  35.48 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.41 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1222  endonuclease III  36.26 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  35.82 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  36.7 
 
 		 256 aa  121  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  37.57 
 
 		 257 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  36.65 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  38.42 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  36.18 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.1 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1159  endonuclease III  33.33 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  38.89 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  33.98 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  36.13 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  35.98 
 
 		 245 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  36.41 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  34.21 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1373  endonuclease III  35.86 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.0581262 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0516  endonuclease III/Nth  34.44 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  34.36 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  36.41 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  34.85 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0960  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.09 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.22 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0326  endonuclease III  35.26 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425287  normal  0.0561637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  36.36 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  34.98 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  37.24 
 
 		 220 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  37.24 
 
 		 220 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  32.31 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  32.98 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.02 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  37.13 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  35.96 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  34.54 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  32.83 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  35.2 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.51 
 
 		 217 aa  114  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.34 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  36.51 
 
 		 236 aa  114  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  34.54 
 
 		 223 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  34.76 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  35.61 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  31.47 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  32.81 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.87 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  35.58 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0512  endonuclease III  34.03 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  34.34 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0468  endonuclease III  33.5 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  35.68 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  35.38 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  35.75 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  35.38 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>