More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0065 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0065  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
403 aa  819    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  52.26 
 
 
393 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 
402 aa  394  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  51.01 
 
 
399 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  50.76 
 
 
399 aa  392  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 
394 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.4 
 
 
655 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.5 
 
 
650 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  48.87 
 
 
394 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 
394 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  48.77 
 
 
403 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  48.87 
 
 
394 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  50 
 
 
392 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  48.87 
 
 
394 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 
394 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 
397 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.87 
 
 
646 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 
398 aa  371  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 
400 aa  375  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  48.87 
 
 
394 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  48.62 
 
 
394 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  48.62 
 
 
394 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  48.37 
 
 
394 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 
394 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  48.62 
 
 
394 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  50 
 
 
396 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  48.62 
 
 
394 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  48.12 
 
 
394 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  47.61 
 
 
396 aa  368  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  48.88 
 
 
399 aa  367  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  49.13 
 
 
397 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  49.13 
 
 
397 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  48.49 
 
 
393 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 
393 aa  362  8e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 
393 aa  359  5e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  48.73 
 
 
399 aa  359  5e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  48.73 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  49 
 
 
395 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  48.49 
 
 
394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 
406 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  44.89 
 
 
399 aa  354  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  48.4 
 
 
401 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  47.61 
 
 
398 aa  354  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  46.62 
 
 
396 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1428  phosphoglycerate kinase  47.15 
 
 
401 aa  354  2e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  49.5 
 
 
392 aa  352  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  50.49 
 
 
402 aa  352  5e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  48.16 
 
 
402 aa  352  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  46.97 
 
 
394 aa  352  7e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  48.77 
 
 
400 aa  352  8.999999999999999e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  47.44 
 
 
398 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  48.39 
 
 
395 aa  351  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  48.39 
 
 
395 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 
398 aa  350  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  47.39 
 
 
400 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  47.39 
 
 
400 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1753  phosphoglycerate kinase  47.86 
 
 
399 aa  348  7e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.093261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  45.41 
 
 
399 aa  348  7e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  47.91 
 
 
401 aa  348  8e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  48.4 
 
 
402 aa  348  9e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  47.15 
 
 
399 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  48.25 
 
 
395 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  47.28 
 
 
402 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.03 
 
 
654 aa  346  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0416  phosphoglycerate kinase  46.23 
 
 
400 aa  346  5e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  47.09 
 
 
394 aa  345  7e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0778  phosphoglycerate kinase  45.61 
 
 
405 aa  345  7e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000119701  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  47.67 
 
 
401 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  48.75 
 
 
394 aa  344  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  47.62 
 
 
393 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  48.16 
 
 
401 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  47.36 
 
 
397 aa  343  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  45.59 
 
 
407 aa  343  2e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  47.5 
 
 
395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  47.61 
 
 
396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  49.38 
 
 
400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  46.75 
 
 
395 aa  343  4e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  47.06 
 
 
402 aa  342  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  46.52 
 
 
397 aa  342  7e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  47.01 
 
 
397 aa  342  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1248  phosphoglycerate kinase  45.02 
 
 
400 aa  340  2e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00549877  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  47.15 
 
 
399 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1398  Phosphoglycerate kinase  47.45 
 
 
398 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  48.38 
 
 
401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  44.86 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  46.75 
 
 
393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  47.44 
 
 
395 aa  339  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  46.81 
 
 
402 aa  340  4e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  46.9 
 
 
397 aa  338  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  47.59 
 
 
396 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  47.88 
 
 
401 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  46.33 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0674  phosphoglycerate kinase  46.63 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  45.25 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  49.13 
 
 
400 aa  337  2.9999999999999997e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 
396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 
396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  47.01 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0739  phosphoglycerate kinase  46.62 
 
 
395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000102804  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  47.01 
 
 
397 aa  336  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>