More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0059 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0059  aminotransferase, class V  100 
 
 
400 aa  818    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.768398  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.43 
 
 
418 aa  331  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  42.78 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.6 
 
 
408 aa  321  9.999999999999999e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.4 
 
 
404 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  40.5 
 
 
420 aa  318  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.28 
 
 
657 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.5 
 
 
572 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  41.73 
 
 
404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  38.65 
 
 
405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  38.65 
 
 
405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  40.78 
 
 
420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.35 
 
 
406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.59 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.35 
 
 
406 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.35 
 
 
406 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  43.15 
 
 
403 aa  312  9e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.44 
 
 
406 aa  311  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.03 
 
 
662 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.4 
 
 
404 aa  310  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.1 
 
 
406 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.9 
 
 
416 aa  310  4e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.2 
 
 
406 aa  309  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  41.41 
 
 
422 aa  309  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.59 
 
 
451 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40 
 
 
420 aa  309  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  40.1 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.61 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.1 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.28 
 
 
414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  40.1 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.16 
 
 
418 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  39.6 
 
 
406 aa  306  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  41.67 
 
 
414 aa  306  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  39.85 
 
 
406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  37.44 
 
 
404 aa  306  6e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.85 
 
 
441 aa  305  8.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  39.4 
 
 
420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  41.96 
 
 
404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.9 
 
 
415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.51 
 
 
414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.85 
 
 
442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.35 
 
 
417 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  39.7 
 
 
423 aa  303  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  37 
 
 
414 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.62 
 
 
605 aa  303  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.88 
 
 
414 aa  302  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.19 
 
 
412 aa  302  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  39.71 
 
 
424 aa  302  9e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  38.69 
 
 
429 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.25 
 
 
406 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.8 
 
 
429 aa  301  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40 
 
 
406 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.51 
 
 
421 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40 
 
 
406 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.25 
 
 
421 aa  301  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.6 
 
 
429 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.35 
 
 
414 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.24 
 
 
413 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.83 
 
 
449 aa  300  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40 
 
 
406 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  36.29 
 
 
425 aa  300  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40 
 
 
406 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  38.73 
 
 
410 aa  300  4e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.6 
 
 
429 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  39.21 
 
 
420 aa  299  5e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.09 
 
 
408 aa  298  9e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  36.54 
 
 
419 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.35 
 
 
429 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.95 
 
 
419 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.7 
 
 
419 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.6 
 
 
406 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  37.32 
 
 
421 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.12 
 
 
410 aa  296  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2996  cysteine sulfinate desulfinase  40.2 
 
 
401 aa  295  6e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  38.32 
 
 
413 aa  295  7e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.7 
 
 
403 aa  295  7e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  40.65 
 
 
405 aa  295  8e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  37.97 
 
 
410 aa  295  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.31 
 
 
774 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.32 
 
 
434 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  41.46 
 
 
417 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.65 
 
 
425 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.3 
 
 
414 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.65 
 
 
414 aa  294  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.9 
 
 
435 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  37.84 
 
 
412 aa  293  3e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.1 
 
 
415 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  36.9 
 
 
412 aa  293  4e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.59 
 
 
428 aa  293  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.9 
 
 
419 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  38.48 
 
 
661 aa  292  6e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.95 
 
 
678 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.77 
 
 
411 aa  292  8e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.95 
 
 
406 aa  292  9e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.6 
 
 
433 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.37 
 
 
406 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.32 
 
 
434 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.07 
 
 
413 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.93 
 
 
412 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>