More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0057 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0057  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
255 aa  525  1e-148  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  50.4 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  49.8 
 
 
248 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  49.8 
 
 
248 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  49.8 
 
 
248 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  48.98 
 
 
248 aa  242  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  48.98 
 
 
248 aa  242  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  49.8 
 
 
248 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  49.8 
 
 
248 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  48.98 
 
 
248 aa  241  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  48.98 
 
 
248 aa  241  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  48.98 
 
 
248 aa  241  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  48.98 
 
 
248 aa  241  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  48.98 
 
 
250 aa  241  9e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  48.45 
 
 
256 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  50.2 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  48.45 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  48.57 
 
 
248 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  47.86 
 
 
250 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  47.76 
 
 
248 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  48.16 
 
 
248 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  48.16 
 
 
248 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  50.2 
 
 
254 aa  236  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  47.6 
 
 
248 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  47.83 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  47.6 
 
 
248 aa  235  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  49.8 
 
 
251 aa  235  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  50 
 
 
257 aa  235  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  46.69 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  48.63 
 
 
280 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  47.15 
 
 
254 aa  232  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 
253 aa  232  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  47.79 
 
 
244 aa  231  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  47.79 
 
 
244 aa  231  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  48.24 
 
 
280 aa  231  8.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  49.4 
 
 
251 aa  231  9e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  47.15 
 
 
248 aa  230  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  45.63 
 
 
261 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01358  Cysteine desulfurase activator ATPase  50.85 
 
 
243 aa  229  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  46.4 
 
 
248 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 
250 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  48.79 
 
 
247 aa  227  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  48.21 
 
 
251 aa  227  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  46 
 
 
248 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  45.6 
 
 
248 aa  226  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  46 
 
 
248 aa  226  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  46.53 
 
 
253 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  46.22 
 
 
252 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  47.97 
 
 
249 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  48.37 
 
 
249 aa  224  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  47.76 
 
 
256 aa  224  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  46.61 
 
 
246 aa  224  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
250 aa  223  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  45.67 
 
 
255 aa  223  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  48.57 
 
 
247 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  46.43 
 
 
264 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  47.81 
 
 
252 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  47.41 
 
 
258 aa  221  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  45.56 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  46.67 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  45.16 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  46.94 
 
 
249 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  47.15 
 
 
261 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3310  FeS assembly ATPase SufC  46.84 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0266816 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  46.15 
 
 
261 aa  216  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  46.03 
 
 
247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  45.02 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  46.12 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1317  FeS assembly ATPase SufC  46.85 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00252118  normal  0.400998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0437  SUF C, ATPase  49 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  43.48 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  43.72 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0566  FeS assembly ATPase SufC  46.59 
 
 
253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  44.35 
 
 
249 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03031  ABC transporter, ATP binding component  44.13 
 
 
262 aa  211  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  46.69 
 
 
249 aa  211  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0904  FeS assembly ATPase SufC  48.97 
 
 
272 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  44.53 
 
 
251 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  45.16 
 
 
249 aa  211  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1193  FeS assembly ATPase SufC  47.04 
 
 
252 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  46.28 
 
 
261 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  46.77 
 
 
247 aa  209  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00811  ABC transporter, ATP binding component  41.87 
 
 
260 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0890  FeS assembly ATPase SufC  46.61 
 
 
268 aa  208  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  42.97 
 
 
263 aa  208  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0074  FeS assembly ATPase SufC  42.28 
 
 
261 aa  208  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0844  FeS assembly ATPase SufC  46.61 
 
 
268 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  44.05 
 
 
271 aa  208  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  43.6 
 
 
250 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  44.94 
 
 
248 aa  208  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00841  ABC transporter, ATP binding component  41.87 
 
 
261 aa  208  6e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.520041  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0894  FeS assembly ATPase SufC  46.61 
 
 
268 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0085  FeS assembly ATPase SufC  44.76 
 
 
253 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  42.58 
 
 
263 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2092  FeS assembly ATPase SufC  48.21 
 
 
252 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  44.31 
 
 
262 aa  206  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  43.82 
 
 
261 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  44.09 
 
 
252 aa  206  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0265  FeS assembly ATPase SufC  44.35 
 
 
248 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000246203  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  45.02 
 
 
250 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>